益脉降脂汤含药血清对THP-1源性泡沫细胞模型miRNA差异表达分析

赖春冰, 古展鑫, 刘锐

海南医学院学报 ›› 2024, Vol. 30 ›› Issue (03) : 183 -191.

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海南医学院学报 ›› 2024, Vol. 30 ›› Issue (03) : 183 -191. DOI: 10.13210/j.cnki.jhmu.20231201.002

益脉降脂汤含药血清对THP-1源性泡沫细胞模型miRNA差异表达分析

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摘要

目的:探讨益脉降脂汤含药血清干预THP-1源性泡沫细胞模型后差异表达miRNA及相关生物功能、信号通路。方法:实验分为巨噬细胞组、泡沫细胞模型组、益脉降脂含药血清组,以佛波酯对THP-1细胞诱导为巨噬细胞,经诱导分化的巨噬细胞给予ox-LDL建立泡沫细胞模型,以益脉降脂汤大鼠血清干预泡沫细胞。提取各组细胞Total RNA进行miRNA测序,筛选差异表达miRNA,预测相关靶基因后进行GO分析、KEGG分析,建立蛋白互作网络、miRNA-靶基因互作网络,RT-qPCR验证改善动脉粥样硬化可能信号通路。结果:空白组与模型组差异miRNA为hsa-miR-302c-3p、hsa-miR-302d-3p、hsa-miR-30d-3p、hsa-miR-3189-3p、hsa-miR-374b-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-4781-3p、hsa-miR-663a;模型组和益脉降脂含药血清组差异miRNA为hsa-miR-3150a-3p、hsa-miR-7704、hsa-miR-877-3p、hsa-miR-150-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-374c-3p、hsa-miR-374b-5p;模型组与益脉降脂含药血清组差异miRNA预测靶基因显示主要富集于MAPK信号通路、ErbB信号通路、Hippo信号通路、Wnt信号通路等信号通路;SCN1A、PRKACA、MECP2、EIF4E、SRSF1、MBNL1、PRKCA、PPARGC1A可能是益脉降脂汤含药血清向THP-1源性泡沫细胞发挥作用潜在关键靶标。结论:hsa-miR-374c-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-374b-5p是益脉降脂汤含药血清作用于泡沫细胞重要的miRNAs,差异表达显著的miRNA以及显著富集的相关信号通路可为诊断和治疗动脉粥样硬化提供新的思路。

关键词

益脉降脂汤 / 泡沫细胞 / miRNA测序 / 生物信息学

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赖春冰, 古展鑫, 刘锐 益脉降脂汤含药血清对THP-1源性泡沫细胞模型miRNA差异表达分析[J]. 海南医学院学报, 2024, 30(03): 183-191 DOI:10.13210/j.cnki.jhmu.20231201.002

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