海南鼠戊型肝炎病毒基因遗传进化分析

摘要

目的：戊型肝炎病毒（hepatitis E virus,HEV）属于戊型肝炎病毒科（Hepeviridae），包括四个属，即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链，长约7 kb的裸露RNA病毒，可以引起急、慢性戊型肝炎，特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前，普遍认为只有HEV-A对人类具有致病性。然而，近期在中国香港、西班牙和中非等地区陆续报告由HEV-C，即鼠戊型肝炎病毒感染引起的戊型肝炎病例，说明HEV-C也是一种人兽共患病毒，可传染于人类。在前期工作中，课题组从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中检测到了HEV-C基因部分片段。为进一步了解海南HEV-C基因分子特征，本研究中扩增了HEV-C全长基因，并对其进行了系统发育分析。方法：使用Trizol试剂从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中分离HEV RNA，并利用Oligo dT引物进一步转录合成cDNA。接着用PCR方法扩增HEV的四个ORF区，并用Sanger法测序，拼接全长HEV基因。利用MEGA X软件的Clustal W方法与参考序列进行比对，并构建系统进化树。结果：通过系统进化树分析发现本研究中扩增的HEV-C为C1型，与广东省湛江市褐家鼠中发现的HEV-C1（基因号：LC549184）的同源性是93.1%，但与我国云南省、香港特别行政区和湖北省等地区的同源性比较远，分别为65.7%、65.9%、85.4%。结论：本研究首次针对海南省褐家鼠携带HEV-C1全长基因进行了系统进化分析。该研究结果提示海南省存在HEV-C的鼠-人传播的潜在风险。因此，应继续控制鼠类的同时，也应预防鼠HEV传染人类的风险。

关键词

肝炎 / 啮齿类动物 / 鼠戊型肝炎病毒 / 海南