干旱胁迫下杜梨叶片差异表达mRNA的转录组分析

王金星; 王中华; 杨青松; 阚佳亮; 王宏; 李晓刚

doi:10.13938/j.issn.1007-1431.20230594

中国南方果树 ›› 2025, Vol. 54 ›› Issue (01) : 112 -116. DOI: 10.13938/j.issn.1007-1431.20230594

干旱胁迫下杜梨叶片差异表达mRNA的转录组分析

王金星, 王中华, 杨青松, 阚佳亮, 王宏, 李晓刚

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摘要

干旱严重影响梨生产，梨主要砧木杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)有抗旱特点，挖掘和鉴定其抗旱基因资源对梨耐旱育种具有重要意义。利用RNA-seq测序技术，以组培杜梨细苗经15%聚乙二醇6000干旱胁迫后0(对照)、24和48 h的叶片为材料构建mRNA文库，经测序最终获得854 138 996个clean reads。与对照相比，干旱胁迫24 h和48 h的差异表达基因分别有3 660和2 078个；与干旱胁迫24 h相比，干旱胁迫48 h的差异表达基因共有2 212个。GO富集分析表明，差异表达基因主要富集在光合作用、有机环状化合物合成、信号识别、钙离子结合、氧化还原酶活性。KEGG分析表明，主要差异的代谢通路为果糖和甘露糖代谢、类黄酮生物合成、植物激素信号转导、光合固碳作用和碳代谢等。经RT-qPCR验证，RNA-seq数据可靠。