基于外壳蛋白基因的广西西番莲夜来香花叶病毒的遗传多样性分析

张莉娟; 林垠孚; 陆覃昱; 莫干辉; 单彬; 苏文潘; 吴凤

doi:10.13938/j.issn.1007-1431.20240255

中国南方果树 ›› 2025, Vol. 54 ›› Issue (05) : 100 -106. DOI: 10.13938/j.issn.1007-1431.20240255

基于外壳蛋白基因的广西西番莲夜来香花叶病毒的遗传多样性分析

张莉娟, 林垠孚, 陆覃昱, 莫干辉, 单彬, 苏文潘, 吴凤

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摘要

为明确夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,TeMV)在广西地区的发生情况和群体遗传特征，对采集自广西13个市西番莲种植基地的187份疑似感病的西番莲样品进行RT-PCR检测，并选取来自不同产区样品的外壳蛋白(coat protein, CP)基因进行克隆和测序，分析其系统发育、遗传进化、种群结构等特征。结果表明，187份样品中162份检出TeMV,检出率为86.6%,获得22个TeMV CP基因序列(GenBank登录号OR786355～OR786369,PP544171～PP544177)。相似性结果表明，22份西番莲TeMV分离物CP基因的核苷酸序列一致性为94.7%～100%,氨基酸序列一致性为95.7%～100%。结合GenBank下载的19条序列的系统发育分析表明，41条序列分为3个大分支，广西西番莲TeMV分离物属于I组；不同国家或地区来源的分离物相互分离，且相同寄主来源的分离物亲缘关系最近。西番莲TeMV分离物CP基因序列无重组现象，进化的主要驱动力是负选择压力。不同群组间的遗传分化显著，基因交流频率低，易发生遗传漂变，群体处于扩张趋势。本研究是针对广西地区西番莲上TeMV遗传变异的首次报道，为广西西番莲TeMV防控提供参考。