牛传染性鼻气管炎病毒感染MDBK细胞转录组分析

刘佳鑫; 马英才; 吕靖青; 甄杰; 刘馨博; 李泽龙; 李娜; 马雪连

doi:10.20088/j.cnki.jxau.2026.03.006

新疆农业大学学报 ›› 2026, Vol. 49 ›› Issue (3) : 227 -234. DOI: 10.20088/j.cnki.jxau.2026.03.006

牛传染性鼻气管炎病毒感染MDBK细胞转录组分析

刘佳鑫, 马英才, 吕靖青, 甄杰, 刘馨博, 李泽龙, 李娜, 马雪连

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摘要

为探究牛传染性鼻气管炎病毒（IBRV）感染牛肾细胞（MDBK）诱导细胞损伤过程中转录组变化情况，本研究采用转录组测序（RNA-seq）、GO和KEGG富集分析、实时荧光定量PCR(qPCR)方法对IBRV（感染复数=1.5）感染24 h后MDBK细胞的基因表达趋势进行了研究。结果表明，IBRV感染后共有800个显著差异表达基因（DEGs），其中592个DEGs上调，208个DEGs下调。GO富集结果显示，DEGs主要与宿主抗病毒反应、醇类生物合成及代谢和转录过程的顺式调控等功能相关。KEGG富集结果显示，DEGs主要富集于流感病毒感染、类固醇生物合成和视黄酸诱导型基因I受体（NLR）等信号通路；PPI物理子网集群主要集中在核糖体组装、寡聚化核苷酸结合结构域样受体（RIG-I）相关的病毒基因组复制负反馈调控和趋化因子受体结合趋化因子；qPCR结果与测序数据一致，RNA-seq数据可靠。IBRV侵入MDBK后，被胞质中RIG-I和NLR识别，引发炎症反应综合征并破坏细胞结构，影响细胞类固醇生物合成和核糖体的生物发生。