生物信息学技术分析人结直肠癌中蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)表达与患者预后及免疫浸润的关系

摘要

目的 通过分析蛋白磷酸酶2A催化亚基α（PPP2CA）在结直肠癌（CRC）中表达水平与患者预后及免疫浸润的关系，进一步了解CRC发生和进展中的相关机制。方法 基于基因芯片数据库Oncomine和肿瘤免疫评估资源（TIMER）数据库分析在CRC组织和正常组织中PPP2CA表达水平的差异性；基于阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户（UALCAN）和基因表达谱交互分析（GEPIA）数据库分析PPP2CA的表达水平对CRC患者预后的影响；基于LinkedOmics平台构建PPP2CA的共表达网络并进行基因本体论（GO）富集分析和京东基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析；基于TIMER和GEPIA数据库分析PPP2CA与免疫浸润之间的相关性。基于c-BioPortal平台分析结肠腺癌（COAD）中PPP2CA的基因突变情况。结果 与正常结直肠组织相比，在CRC组织中PPP2CA表达下调。高表达水平的PPP2CA预示着更好的总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）。在COAD中，PPP2CA的表达水平与包括CD8⁺ T细胞、中性粒细胞和树突状细胞在内的免疫浸润细胞呈正相关。而某些免疫细胞标志物，包括B细胞的CD19和CD38、 M1巨噬细胞的一氧化氮合酶2（NOS2）、 M2巨噬细胞的精氨酸酶1（Arg1）和甘露糖受体C1（MRC1）、肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的人类白细胞抗原G（HLA-G）和CD80、单核细胞的CD14和IgG Fc段受体Ⅲa（FCGR3A）,却显示出不同的PPP2CA相关免疫浸润模式：即PPP2CA表达水平与COAD和直肠腺癌（READ）中的B细胞、巨噬细胞、单核细胞、 TAM、 1型辅助T（Th1）细胞、 Th2细胞、调节性T细胞、衰竭T细胞和中性粒细胞均显著相关。结论PPP2CA在CRC组织表达水平下调，并且与免疫浸润密切相关。

关键词

蛋白磷酸酶2A催化亚基α基因(PPP2CA) / 结直肠癌(CRC) / 免疫浸润 / 预后