TXN在泛癌中的表达特征及其对肿瘤免疫及预后的影响

摘要

目的 TXN是一种硫氧还蛋白(TXN),参与许多氧化还原反应，在多种信号通路中起着关键作用。然而，TXN在泛癌中的作用仍然不清楚。本研究旨在探讨及可视化TXN表达在泛癌中的诊断、预后和免疫学分析。方法 从癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库下载临床数据，分析TXN在泛癌中的表达水平，并通过人类蛋白质图谱(HPA)(https://www.proteinatlas.org/)数据库初步验证。采用ESTIMATE和CIBERSORT算法评估TXN表达与免疫细胞浸润的相关性。同时，利用Spearman方法分析TXN与微卫星不稳定性(MSI)及肿瘤突变负荷(TMB)在肿瘤中的相关性。此外，通过基因集富集分析(GSEA)探讨TXN的生物学功能，并运用CellMiner数据库评估其与癌症治疗药物的敏感性关系。结果 TXN在大多数恶性肿瘤中表现出高水平表达。其高表达与多种癌症的生存存在显著相关性。此外，TXN表达水平也与TMB、MSI、肿瘤微环境和化疗敏感性等密切相关。结论 TXN有望作为泛癌中的潜在预后生物标志物。同时，黄酸(维甲酸)诱导基因蛋白I(RIG-I)样受体信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路以及核苷酸寡聚化结构域(NOD)样受体信号通路可能在TXN对肿瘤免疫的调节中发挥关键作用。

关键词

肿瘤微环境 / 硫氧还蛋白(TXN) / 泛癌 / 药物敏感性 / 生物信息学