基于单细胞测序探索伴有引流淋巴结肺腺癌患者的免疫景观

摘要

目的 通过单细胞测序技术（SCT）探讨伴有引流淋巴结（DLN）肺腺癌（LUAD）患者的免疫景观。方法 从美国国家生物技术信息中心（NCBI）的基因表达综合数据库（GEO）获取肺癌单细胞数据集（数据编号GSE277742）,该数据集包括18名经病理证实存在淋巴结转移的患者和4名没有转移证据的对照患者的胸腔内DLN。使用R语言进行数据质量控制、降维聚类和细胞亚群注释及细胞通信分析，识别关键细胞亚群并筛选差异表达基因；并利用癌症基因组图谱（TCGA）数据库进行Kaplan-Meier生存分析。结果 单细胞测序分析显示，伴有DLN的患者中CD8⁺T细胞比例较高，其中细胞周期蛋白依赖激酶6（CDK6）、细胞周期蛋白D3（CCND3）、 CCNH、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A/B/D（CDKN2A/B/D）、视网膜母细胞瘤蛋白1（RB1）呈显著高表达；TCGA数据库分析表明，BIOCARTA＿CELLCYCLE＿PATHWAY通路的相关基因在患者与正常样本中表达差异显著，且与生存期相关。结论 通过生物信息学方法筛选出多个在LUAD患者DLN中差异表达的关键基因，为深入解析伴有DLN的LUAD免疫微环境的调控机制提供了新视角。

关键词

肺腺癌(LUAD) / 引流淋巴结(DLN) / 单细胞测序 / 生存分析 / 细胞亚群 / 关键基因

基金资助

贵中医科余(2025)48号