肾癌相关miRNAs及靶基因对肾癌预后的评估价值

摘要

目的 基于美国癌症基因组图谱(TCGA)构建肾癌miRNAs预后风险模型评分公式，分析这个评分公式评估miRNAs及其靶基因作为肾癌预后分子标志物的潜在临床价值。方法 基于TCGA肾癌miRNAs与mRNA测序数据，采用单因素、Lasso和多因素Cox回归分析，构建肾癌miRNAs预后风险模型；通过对靶基因进行GO、KEGG富集分析，筛选相关miRNAs;在临床样本中验证预后风险模型中筛选出的miRNAs及其靶基因的表达。结果 基于TCGA数据库，在肾癌与其癌旁样本转录组数据中共找到94个差异miRNAs和1 226个差异mRNAs,独立预后分析筛选得到7个miRNAs。GO与KEGG富集分析结果提示，7个miRNAs的功能与PI3K-Akt信号通路、钙离子信号通路、MAPK信号通路有关。采集肾癌临床样本，应用qPCR分析，结果显示，5个miRNAs在肾癌临床样本中的表达模式与TCGA数据库中的表达模式一致，miRNAs的8个靶基因表达模式与其在TCGA数据库中的表达趋势一致。免疫组化结果显示，HPGD在肾癌中低表达。结论 构建的肾癌miRNAs预后模型能有效筛选肾癌预后相关miRNAs,这些miRNAs的研究对揭示肾癌发生与发展机制及评估肾癌预后具有重要意义。

关键词

肾癌 / miRNAs / 靶基因 / 预后风险模型