基于RNA-seq技术探索铁死亡在肝癌细胞对仑伐替尼耐药中的作用

摘要

目的 探究铁死亡在肝癌细胞对仑伐替尼（Lenva）耐药中的作用，为预防或逆转Lenva耐药提供新思路。方法 体外培养人肝癌细胞系PLC/PRF/5,即亲本细胞（PC）采用梯度浓度诱导法构建Lenva耐药细胞（LRC）;利用RNA-seq技术对LRC和PC两种细胞进行转录组测序，测序结果进行差异表达基因分析及KEGG富集分析；采用CCK-8法测定细胞活力，采用免疫印迹检测铁死亡相关蛋白，利用DHE探针检测细胞活性氧（ROS）,应用透射电镜观察细胞线粒体形态。结果 Lenva处理PC和LRC 24 h,半数抑制浓度(IC₅₀)分别为24.88μmol/L和89.34μmol/L,提示Lenva耐药人肝癌细胞体外诱导成功。RNA-seq测序检测到12 106个基因，与PC比较，LRC 88个基因上调，197个基因表达下调。差异基因的KEGG通路富集分析结果显示，铁死亡信号通路位列其中。利用10μmol/LLenva处理细胞48 h,与PC相比，LRC铁死亡相关蛋白SLC7A11和GPX4表达增加，ROS含量降低。电镜结果显示，与PC相比，特征性铁死亡线粒体形态改变的LRC明显减少。结论 肝癌细胞对Lenva耐药可能涉及多种基因和信号途径，其中铁死亡抵抗机制可能是引起肝癌细胞耐Lenva的关键。

关键词

仑伐替尼 / 肝癌 / 耐药 / 铁死亡

基金资助

国家自然科学基金项目(81960520); 广西科技厅中央引导地方科技发展资金项目(桂科ZY21195024); 广西自然科学基金重点项目(2020GXNSFDA238006); 桂林市第三批漓江学者支持计划(2022-5-07)