单细胞RNA测序揭示肺腺癌微环境细胞特征与通讯差异

摘要

目的 本研究旨在利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术，系统分析肺腺癌与健康组织中的细胞组成、差异基因表达及细胞通讯网络的特征差异，以揭示关键细胞和信号通路在肺腺癌微环境中的作用。方法 从公开数据库获取3个肺腺癌(LUAD)样本和3个健康样本的单细胞RNA测序数据，并将两种样本分别列为LUAD组和正常组。通过Seurat包进行数据预处理、归一化、降维和聚类分析，识别细胞类型。使用差异表达基因分析和GO富集分析，结合CellChat工具进行细胞间通讯分析，探讨LUAD组和正常组之间的差异。结果 LUAD组与正常组在细胞群体分布和免疫细胞比例上存在显著差异。LUAD组中免疫细胞比例较低，而上皮细胞占据较大比例。差异表达基因分析显示，LUAD组中的免疫反应通路显著下调。CellChat分析揭示LUAD组与正常组在细胞间通讯的显著差异，特别是在免疫细胞之间的信号传递上，LUAD组的通讯较为受限。结论 LUAD组与正常组在免疫反应和细胞间通讯方面存在显著差异，LUAD组免疫反应受抑制且细胞间通讯受限，这可能是肿瘤微环境中免疫逃逸的关键因素。

关键词

肺腺癌 / 单细胞RNA测序 / 肿瘤微环境 / 细胞通讯网络

基金资助

国家自然科学基金项目(32160147,32460152)