国产洋酸浆属叶绿体基因组密码子偏好性分析

张吉斯; 来亚梅; 冯淼

doi:10.20212/j.issn.1008-2441.2025.06.010

鞍山师范学院学报 ›› 2025, Vol. 27 ›› Issue (6) : 67 -72. DOI: 10.20212/j.issn.1008-2441.2025.06.010

国产洋酸浆属叶绿体基因组密码子偏好性分析

张吉斯, 来亚梅, 冯淼

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摘要

运用CodonW、CUSP和SPSS 29.0等软件对国产洋酸浆属5个种叶绿体基因组密码子的GC含量、ENC值及RSCU等相关参数进行分析，旨在揭示该属碱基分布特征及其密码子使用偏好.结果表明：5个种在密码子不同位置的GC含量呈现GC1>GC2>GC3的非均匀分布趋势，并普遍倾向于使用A/U碱基；ENC值及其相关性分析显示，该属叶绿体基因组密码子偏好性较弱，且主要受第3位碱基组成变化的影响；RSCU分析进一步证实其偏好使用以A/U结尾的同义密码子.本研究结果为后续在翻译水平上优化洋酸浆属植物外源基因的异源表达策略提供了理论支持.