基于SCoT标记的56份蒲公英种质遗传多样性分析

摘要

为深入了解蒲公英（Taraxacum）种质资源的遗传多样性以及亲缘关系，本文采用目标起始密码子多态性标记（SCoT）技术，以收集的56份蒲公英种质资源为试验材料，从80个SCoT引物中筛选出多态性较高的引物对供试材料进行PCR扩增，分析不同蒲公英种质资源的多态性、遗传多样性，并对居群进行主成分及聚类分析。结果显示：从80个SCoT引物中筛选出33个多态性高、重复性好的引物，共扩增出4 892条多态性条带，多态性比率94.75%，平均每条引物可扩增出多态性条带148.24条。观测等位基因数（Na）的均值1.96，有效等位基因数（Ne）的均值1.66,Nei′s基因多样性指数（H）均值为0.38,Shannon′s信息指数（I）均值为0.55，表明供试56份蒲公英材料具有较高的遗传多样性水平；蒲公英种质资源居群间的遗传距离介于0.034 5～0.209 0，平均值为0.112 7，其中河南省和江苏省的遗传距离最大且遗传一致性最小，福建省和甘肃省的遗传距离最小且遗传一致性最大。居群间遗传距离与遗传一致性呈正态分布，且存在较大遗传差异；56份蒲公英遗传相似系数在0.54～0.97，聚类分析显示在遗传相似系数0.56处可将56份蒲公英种质聚为2个类群，药用蒲公英（Taraxacum officinale）、碱地蒲公英（Taraxacum borealisinense）、鸡西蒲公英（鸡西栽培种）聚为1类，表明亲缘关系较近，均为药用蒲公英。综合研究结果表明：基于SCoT分析供试的56份蒲公英种质遗传多样性，其表现出丰富的多态性，表明可以用SCoT标记技术对蒲公英进行分子水平的遗传多样性研究。

关键词

蒲公英 / SCoT分子标记 / 聚类分析 / 遗传多样性