基于全基因组重测序和叶绿体DNA序列的河北魏县梨地方品种资源分析

摘要

【目的】解析河北魏县梨地方品种的遗传背景，探讨魏县梨种质间的亲缘关系。【方法】以20个河北省魏县梨地方品种以及10个河北其他地区代表性梨地方品种为研究试材，基于全基因组重测序数据和叶绿体DNA变异信息开展河北魏县梨地方品种的分子鉴定。【结果】魏县梨地方品种具有明显的群体遗传结构，可分为两大类：类群1由魏县红梨等9份材料组成，与南方梨品种群亲缘关系较近，类群2由小白面等11份材料组成，更接近北方梨品种群。叶绿体DNA非编码区域的测序结果显示，在魏县梨地方品种中检测到3种较进化的单倍型，大部分地方品种的单倍型为H＿3，魏县红梨的单倍型为H＿2，雪花以及除金丰鸭梨外的鸭梨品种群的单倍型为H＿1。分析品种间的亲缘关系和单倍型类别，鉴定金丰鸭梨并非鸭梨的芽变品种，可能为鸭梨的实生后代选育而成。白雪花不是雪花的芽变，白红梨不是魏县红梨的芽变，油秋与武安油秋两者的遗传背景存在显著差异，证实白砘子梨是砘子梨的芽变选育品种。【结论】明确魏县梨地方品种的亲缘关系和遗传背景，为魏县地方梨种质资源的保护和高效利用提供理论基础。

关键词

魏县梨 / 全基因组重测序 / 叶绿体DNA / 亲缘关系

基金资助

中国农业科学院科技创新工程（CAAS-ASTIP-2021-RIP-01）; 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系（CARS-28-01）