基于SSR标记的余甘子遗传多样性分析与核心种质构建

王建超, 张小艳, 张立杰, 李韬, 谢丽雪

果树学报 ›› 2025, Vol. 42 ›› Issue (8) : 1672 -1686.

果树学报 ›› 2025, Vol. 42 ›› Issue (8) : 1672 -1686. DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20250079

基于SSR标记的余甘子遗传多样性分析与核心种质构建

    王建超, 张小艳, 张立杰, 李韬, 谢丽雪
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摘要

【目的】利用SSR分子标记开展余甘子遗传多样性分析和核心种质构建研究,为余甘子种质资源保存、遗传育种和高效利用提供科学依据。【方法】利用余甘子SSR分子标记分析192份余甘子(Phyllanthus emblica Linn.)与1份近缘种小果叶下珠(P. reticulatus Poir.)的遗传多样性和亲缘关系;从聚类方法、取样策略和取样比例筛选构建余甘子核心种质最佳方案,并检验其有效性。【结果】10对SSR引物在193个样本中共检测到85条多态性条带,多态信息含量0.77,余甘子遗传距离范围0~0.958 3,余甘子种质资源间的遗传分化水平高,多样性丰富。经聚类分析,192份余甘子可分为3个组别,相同生态分布区的种质亲缘关系相对较近。筛选出构建余甘子核心种质最佳方案为Jaccard遗传距离+类平均法+优先取样策略+10%取样比例,经检验,构建出的初级核心种质既有效排除了原种质遗传冗余,又确保了代表性和异质性。【结论】余甘子种质资源的遗传分化水平高,遗传多样性丰富;利用余甘子SSR多样性数据构建核心种质最佳方案为Jaccard遗传距离+类平均法+优先取样策略+10%取样比例,构建包含20份余甘子的核心种质,为种质资源收集保存及创新利用提供了科学依据。

关键词

余甘子 / 简单重复序列 / 遗传多样性 / 核心种质

Key words

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王建超, 张小艳, 张立杰, 李韬, 谢丽雪. 基于SSR标记的余甘子遗传多样性分析与核心种质构建[J]. 果树学报, 2025, 42(8): 1672-1686 DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20250079

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科技部、财政部国家科技资源共享服务平台(NTPGRC2024-011); 福建省属公益类科研院所专项(2022R1028004,2024R1027002); 福建省人民政府与中国农业科学院农业高质量发展超越“5511”协同创新工程项目(XTCXGC2021019-GSS01)

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