阳光玫瑰×寒香蜜杂交群体果实与叶片性状关联的KASP分子标记开发

庞柳; 陈烨锜; 郑婷; 魏灵珠; 向江; 吴江; 郑伟尉; 程建徽

doi:10.13925/j.cnki.gsxb.20250308

果树学报 ›› 2026, Vol. 43 ›› Issue (3) : 493 -504. DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20250308

阳光玫瑰×寒香蜜杂交群体果实与叶片性状关联的KASP分子标记开发

庞柳, 陈烨锜, 郑婷, 魏灵珠, 向江, 吴江, 郑伟尉, 程建徽

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摘要

【目的】开发葡萄叶片和果实性状的竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele specific PCR,KASP)标记，为葡萄分子标记辅助育种提供技术支撑。【方法】以阳光玫瑰（Vitis vinifera×V. labrusca‘Shine Muscat’）和寒香蜜（V. vinifera×V. labrusca‘Suffolk Red’）及其150个杂交后代为材料，采集叶片与成熟果实，利用Illumina平台进行PE150全基因组重测序，进行群体单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）检测、核心SNP筛选及KASP标记开发，并联合表型数据开展性状关联分析。【结果】获得819 Gb高质量测序数据，检测到432 926个SNP，筛选出74个核心SNP并成功开发19个KASP标记。KEGG富集分析显示，标记所在基因显著富集于黄酮和黄酮醇生物合成通路。通过表型-基因型关联分析筛选出14个与叶片大小（4个）、果实大小（2个）、糖含量（4个）及总酚/类黄酮含量（3个）相关的KASP标记。【结论】本研究开发的14个KASP标记可用于葡萄叶片与果实性状的早期筛选，其关联的黄酮合成等通路为品质育种提供了理论参考。