猕猴桃组蛋白甲基化和去甲基化酶家族基因鉴定及其对不同非生物胁迫的表达分析

摘要

【目的】鉴定猕猴桃组蛋白甲基化酶（HMTs）和去甲基化酶（HDMs）基因家族成员，并分析其在非生物胁迫下的表达响应，揭示其在逆境适应中的调控机制。【方法】通过生物信息学方法，从猕猴桃基因组数据库利用中华猕猴桃Actinidia chinensis(Red5)基因组数据筛选基因序列，进行染色体定位、保守结构域分析、系统进化树构建及共线性分析。以郁香猕猴桃为试验材料，分析盐胁迫、干旱胁迫及温度胁迫处理对猕猴桃HMTs和HDMs基因家族表达模式的影响。【结果】鉴定出83个基因家族成员（55个HMTs和28个HDMs），包括SDG、PRMT、JMJ和HDMA亚家族。结构分析显示，不同亚家族基因具有独特的保守结构域；进化分析表明，猕猴桃与拟南芥的同源基因相似，但JMJD6和JMJC亚族基因较少；共线性分析揭示基因扩张主要源于全基因组复制事件。表达分析显示，HMTs和HDMs基因家族不同程度地参与盐、干旱、低温及高温胁迫响应。【结论】共鉴定了83个猕猴桃HMTs和HDMs基因家族成员，其中AcSDG35和AcSDG54可能广泛参与盐、干旱、低温及高温胁迫调控。

关键词

猕猴桃 / 组蛋白甲基化酶(HMT) / 组蛋白去甲基化酶(HDM) / 非生物胁迫

基金资助

国家现代农业产业技术体系建设专项（CARS-26）; 陕西省农业关键核心技术攻关项目（2024NYGG007）