大豆DHQ-SDH基因家族生物信息学分析

摘要

运用生物信息学方法，对鉴定出的13个大豆DHQ-SDH基因家族成员的理化性质、染色体定位、基因结构、顺式作用元件、系统发育进化树、二级结构、三级结构、保守基序以及转录后调控等进行了预测及分析。结果表明，Gm DHQ-SDH基因家族的13个成员分别分布在5条染色体上；13个家族成员的蛋白质分子量介于44.36～62.98 k D之间，均属于稳定蛋白，且大多数为疏水蛋白；二级结构与三级结构预测结果发现，13个家族成员均以α-螺旋为主，其次为随机卷曲，其三级结构具有很高的相似性；保守基序结果表明，Gm DHQSDHs分为4组，每个家族成员均含有DHQas＿1结构域。大豆DHQ-SDH基因家族成员的启动子区域含有光响应元件、逆境胁迫响应元件、激素应答响应元件、生长发育调控响应元件，其中，光响应元件占比最高，可对低温、干旱以及厌氧胁迫做出反应。

关键词

大豆 / DHQ-SDH基因 / 基因家族 / 生物信息学分析

基金资助

国家民委科尔沁沙地生态开放项目（MDK2022029,MDK2021084）;国家民委科尔沁沙地重点实验室开放基金项目（MDK2021085）; 内蒙古自治区自然科学基金项目（2021LHMS03010）