蓖麻CNGC基因家族的鉴定与系统进化分析

摘要

环核苷酸门控离子通道（Cyclic nucleotide-gated channels,CNGCs）在植物器官生长发育、信号传导和对逆境胁迫响应等过程中发挥重要作用。运用生物信息学手段，对蓖麻CNGC家族的分类、系统进化树、组织表达蛋白的亚细胞定位、跨膜结构以及等电点等进行系统分析。结果表明，CNGC家族中的14个成员被成功鉴定，且在细胞质膜上定位到了编码的蛋白，跨膜数量为4～7个不等，等电点位于8.66～9.69之间，蛋白质分子质量平均为21.32 k D。系统进化树分析结果表明，RcCNGC基因家族成员分为4个亚群，第Ⅳ亚群与其他亚群亲缘关系较远。motif预测结果显示，位于第Ⅳ亚群的RcCNGC20具有9个motif，其他蛋白均含有8个motif，且排列顺序也与其他蛋白有差异。

关键词

蓖麻 / 环核苷酸门控离子通道 / 基因家族 / 系统进化分析

基金资助

国家自然科学基金项目（31760399,31460353）; 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新中心开放课题（MDK2023083）