基于SE-Connection Pyramid Network网络的蛋白质-DNA结合位点预测

张辰瑞; 姜静清; 赵芳; 宋佳智

doi:10.14045/j.cnki.15-1220.2025.03.009

内蒙古民族大学学报（自然科学版） ›› 2025, Vol. 40 ›› Issue (3) : 62 -70. DOI: 10.14045/j.cnki.15-1220.2025.03.009

基于SE-Connection Pyramid Network网络的蛋白质-DNA结合位点预测

张辰瑞, 姜静清, 赵芳, 宋佳智

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摘要

蛋白质与DNA的结合过程对于生物体内基因表达及调控至关重要，准确预测蛋白质上的DNA结合位点对于理解生命活动具有重要意义。构建一种基于SE-Connection Pyramid Network(SECP-Net)网络的蛋白质-DNA结合位点预测模型，该模型结合了金字塔结构及Squeeze-and-Excitation模块，能够有效提取多尺度特征并动态调整特征通道的权重。通过对PDNA-62和PDNA-224数据集的实验验证，结果表明，SECP模型在多个评价指标上均优于传统模型，展现出其在蛋白质-DNA结合位点预测中的良好性能。