‘红阳’猕猴桃YABBY基因家族的鉴定分析

摘要

YABBY基因家族是种子植物中特有的一类转录因子，在植物叶片器官的发育以及对非生物和生物胁迫的响应过程中起着至关重要的作用。采用生物信息学方法，对‘红阳’猕猴桃（Actinidia chinensis Hongyang）的YABBY基因家族开展鉴定，最终筛选得到12个该基因家族成员，并进一步分析了这些成员的理化性质、保守结构域、顺式作用元件及系统进化特征。研究结果显示：12个基因共编码133～340个氨基酸。分子质量为19 873.48～38 479.97 Da，等电点分布在6.25～9.45之间，所有蛋白质均被界定为亲性水蛋白，且经判定均属于不稳定蛋白；12个目标基因各自含有5～7个外显子，以及包含4～6个内含子。在YABBY基因的启动子序列中，分布着多个可响应光信号与激素作用的顺式作用元件。此外，系统进化分析‘红阳’猕猴桃YABBY基因，可以将其分为3个亚族，且同亚族的基因具有一致的内含子数目、外显子数目及结构、亚族共享基序等特征。研究可为进一步探讨YABBY基因对‘红阳’猕猴桃的生长发育、逆境胁迫等生理过程奠定基础。

关键词

‘红阳’猕猴桃 / YABBY基因家族 / 生物信息学分析 / 基因调控