一种筛选水稻Mutmap+突变位点的简易方法

摘要

利用基因组重测序技术进行基因定位目前已在水稻功能基因组学研究中得到广泛应用。其中，Mutmap+技术因无需进行杂交操作，且无需背景亲本的基因组信息，具有更广阔的应用前景。然而，目前Mutmap+技术筛选候选突变位点的方法依赖于复杂的数据计算，要求研究者具有较高的生物信息学知识。根据Mutmap+的实验原理，设计一种简单的筛选候选突变位点的方法。该方法对混池测序的表型池与非表型池的突变指数分别加以限定，即表型池突变指数等于1,非表型池突变指数小于0.5。对测序所得突变位点进行简单排序，即可得到候选突变位点。运用该筛选方法，从6个水稻不育突变体成功克隆突变基因，并对其中1个突变体进行了细胞学表型的验证。该方法可简化Mutmap+技术的数据分析流程，便于将Mutmap+技术更好地运用到水稻功能基因组学研究中。

关键词

水稻 / Mutmap+ / 突变位点筛选 / 基因克隆