香樟bZIP基因家族鉴定及表达分析

朱渊铭; 张培兰; 林宇清; 陈丝雨; 苏宝川; 邹双全

doi:10.16872/j.cnki.1671-4652.2024.03.005

扬州大学学报（农业与生命科学版） ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (03) : 44 -54+81. DOI: 10.16872/j.cnki.1671-4652.2024.03.005

香樟bZIP基因家族鉴定及表达分析

朱渊铭, 张培兰, 林宇清, 陈丝雨, 苏宝川, 邹双全

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摘要

碱性亮氨酸拉链(bZIP)基因能响应多种非生物胁迫，为探究香樟(Cinnamomum camphora)bZIP基因是否具有调控非生物胁迫的能力，对其进行全基因组鉴定和系统进化分析，并分析其保守基序、基因结构、保守结构域、理化性质及顺式作用元件。结果表明：香樟中共有56个bZIP基因(CcbZIP),分为10个亚族。同一亚家族的基因保守基序相似，而不同亚家族的基因保守基序存在较大差异。56个CcbZIP基因不均匀地分布在12条染色体上，且存在片段复制事件，香樟与毛果杨(Populus trichocarpa)的共线基因最多。CcbZIP基因家族含有光响应元件最多，还含有大量干旱、低温、厌氧等非生物胁迫响应元件和激素类响应元件。表达量分析显示，土壤肥力差的环境下多数CcbZIP基因在枝和叶中高表达，施肥后土壤肥力增强而基因表达量降低。