大麦抗赤霉病近等基因系的转录组分析

摘要

赤霉病是大麦主要病害之一,严重影响大麦产量与品质。为研究大麦赤霉病抗性分子机制,以2个大麦赤霉病抗、感近等基因系N53和T66为材料,利用转录组测序技术(RNA-Seq),分析N53、T66在接种禾谷镰刀菌后不同时间点的基因表达特征和差异。结果表明:以接种0 h作为对照,N53和T66分别鉴定出15 230和15 106个差异表达基因。不同接种时间点上、下调的基因数目和富集到GO及KEGG通路的基因数目在两材料间存在显著差异。不同处理组间共筛选出421个共同差异表达基因,GO功能注释分类分成3大类42个亚类,KEGG通路共涉及到21个,并在信号转导(signal transduction)、植物-病原体相互作用(plant-pathogen interaction)、植物激素信号转导(plant hormone signal transduction)、MAPK-信号通路-植物(MAPK signaling pathway-plant)、苯丙烷类生物合成(phenylpropanoid biosynthesis)通路显著富集。综上,这一研究从转录组水平初步探索大麦对赤霉病的响应机制,可为进一步挖掘大麦赤霉病抗性候选基因、明晰大麦赤霉病抗性分子机制提供参考。

关键词

大麦 / 赤霉病 / 近等基因系 / 转录组分析 / 差异表达基因