山羊肠道微生物群发育与多样性分析

摘要

为了解山羊肠道微生物群成员的多样性及其发育规律,从江苏2个不同山羊养殖场随机选择2只山羊,分别在1、3、5、10、20、30、40、45、50、60、70、80和90日龄时采集新鲜粪便样品,并采用宏基因组测序对所有样品进行分析。结果表明:山羊肠道微生物群的成员和丰度随日龄增长而不断变化,并受哺乳和采食的影响。其中,40日龄哺乳期山羊的肠道微生物有600余种,90日龄断奶山羊肠道微生物群最终稳定在1 500种左右。在80多种核心成员中,脆弱拟杆菌、大肠埃希菌和丁酸球菌是哺乳羔羊肠道中的优势细菌,而栖瘤胃普雷沃菌和厚壁菌在断奶山羊肠道细菌群中占主导地位。值得注意的是宋内志贺菌、鲍氏志贺菌、福氏志贺菌、痢疾志贺菌、肠道沙门菌、邦戈里沙门菌、梭状芽孢杆菌、格氏乳球菌和幽门螺杆菌等人兽共患细菌也可在山羊中检测到,这提示山羊可能是这些微生物的宿主。

关键词

山羊 / 肠道菌群 / 发育 / 多样性