生防假单胞菌FD6中小RNA cspA功能的初步研究

摘要

生防假单胞菌FD6抑菌谱广，可产生多种次生代谢产物。细菌小RNA参与调节细胞的不同生理过程，为探究生防假单胞菌FD6中小RNA cspA对生防相关性状表达的影响，从菌株FD6基因组中挖掘出3个同源小RNA cspA1、cspA2、cspA3,对其进行生物信息学分析，并采用过量表达和插入突变的方法鉴定其生物学功能。结果表明：cspA1、cspA2、cspA3的RNA序列长度分别为356、416、397 bp,均具有启动子和Rho-independent终止子。cspA1、cspA2、cspA3核苷酸相似性达66.35%,其基因与猪链球菌基因组中的cspA相似性达59%。cspA2、cspA3过表达可降低胞外蛋白酶的产生；cspA1、cspA2、cspA3过表达显著降低FD6的游动能力；cspA1、cspA2过表达及cspA3突变可降低嗜铁素的分泌；cspA2过表达促进FD6生物膜的形成，而cspA1、cspA2突变则导致其生物膜形成能力降低。综上，cspA1、cspA2、cspA3基因可能参与调控不同生防表型，今后需进一步解析其生物学功能及调控机制。

关键词

生防假单胞菌 / FD6 / 小RNA cspA / 生防相关表型