水稻抗纹枯病种质YSBR1的基因组组成特征分析

赵剑华; 居冉; 王雨; 高鹏; 冯志明; 谢文亚; 胡珂鸣; 陈夕军; 左示敏

doi:10.16872/j.cnki.1671-4652.2025.04.002

扬州大学学报（农业与生命科学版） ›› 2025, Vol. 46 ›› Issue (04) : 12 -21. DOI: 10.16872/j.cnki.1671-4652.2025.04.002

水稻抗纹枯病种质YSBR1的基因组组成特征分析

赵剑华, 居冉, 王雨, 高鹏, 冯志明, 谢文亚, 胡珂鸣, 陈夕军, 左示敏

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摘要

纹枯病是世界性的水稻主要病害，前期从籼粳交后代中选育到1个高抗纹枯病种质YSBR1，但基因组组成特征一直不明，不利于对其携带抗病基因进行遗传分析。利用PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等测序技术，构建YSBR1端粒到端粒（T2T）的完整基因组，获得37 750个基因，其中2 763个为YSBR1所特有。比较基因组分析表明，YSBR1基因组呈现多源嵌合特征，其中籼稻来源占比60.31%，粳稻、奥斯稻、香稻和水稻亚群间保守序列分别占比22.27%、4.98%、3.94%、8.50%。不同类型基因组间的渗入可能聚合了不同抗纹枯病优异等位基因，推测是YSBR1高抗纹枯病的重要原因之一。这一研究可为水稻抗纹枯病机制解析及从YSBR1中发掘更多有利基因提供关键的基因组数据资源。