鸽Viperin基因克隆及生物信息学功能分析

王鑫; 朱奕锟; 黄宇飞; 杨盛

doi:10.16872/j.cnki.1671-4652.2025.05.004

扬州大学学报（农业与生命科学版） ›› 2025, Vol. 46 ›› Issue (05) : 31 -38. DOI: 10.16872/j.cnki.1671-4652.2025.05.004

鸽Viperin基因克隆及生物信息学功能分析

王鑫, 朱奕锟, 黄宇飞, 杨盛

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摘要

为探究鸽内质网相关、干扰素诱导型病毒抑制蛋白(Viperin)的基因结构并预测其生物学功能，采用巢式PCR方法获得鸽Viperin基因的CDS序列，通过生物信息学手段分析其序列特征、结构域、系统进化关系及潜在功能。结果表明：鸽Viperin基因的CDS区长共1 077 bp,编码358个氨基酸，属于较不稳定蛋白质，无信号肽，蛋白质中间区域亲水性较高，N端可能存在跨膜区。二级结构分析发现鸽Viperin蛋白中α螺旋和β折叠分别占比33%和13%。三级结构显示该Viperin蛋白是由α螺旋包裹在β折叠外侧形成的经典桶状结构。多序列比对结果表明不同物种间除N端之外其他区域均表现出高度保守性。蛋白质互作网络分析发现Viperin与CMPK2、IRF1和TRAF6等免疫调控因子相关。综上，该研究结果可为鸽Viperin蛋白的功能研究提供理论基础。