基于转录组学探究金鱼早期发育过程中脂代谢相关基因的表达

摘要

为探究金鱼(Carassius auratus)早期发育过程中脂代谢相关基因的表达情况，本研究通过转录组测序分析了金鱼2种品系(鹤顶红与珍珠)早期发育3个时间点(0 h、48 h、5 d)的差异表达基因，并进行了qRT-PCR验证。结果表明，2种金鱼早期发育的3个时期均存在大量的差异表达基因。富集分析显示，2种金鱼48 h vs 0 h组、5 d vs 48 h组、5 d vs 0 h组下调差异基因主要富集在RNA转运、嘧啶代谢、卵母细胞减数分裂等通路，但上调差异基因仅在5 d vs 48 h存在富集的通路，且2种金鱼均富集在PPAR信号通路。根据富集分析结果，推测apoba、fads2、pparα、pparγ等12个关键基因参与金鱼早期发育过程中的脂质代谢调控。综上，2种金鱼5 d和48 h 2个发育时期均在PPAR信号通路及脂代谢相关基因表达水平上呈现显著差异，证实金鱼出膜后脂质代谢能力显著增强。

关键词

金鱼 / 早期发育 / 脂代谢 / 转录组学 / 差异表达基因