血友病A miRNA-mRNA调控网络构建及靶向治疗药物预测

摘要

目的:构建血友病A(HA)患者的miRNA-mRNA调控网络，并预测HA的潜在靶向治疗药物。方法:选取9例男性HA患者的全血样本进行mRNA测序，并采用来自基因型-组织表达数据库的43例正常男性血液样本的RNA测序数据，使用R 4.3.2的DESeq 21.42.1包鉴定差异表达的mRNA(DEmRNA)。从基因表达综合数据库筛选5名正常人和6名无FⅧ自身抗体的HA患者的miRNA测序数据，使用limma包鉴定差异表达miRNA(DEmiRNA),并利用TargetScanHuman等数据库预测DEmiRNA的靶基因，构建miRNA-mRNA负调控网络。基于EpiMed平台和计算机辅助药物设计技术(CADD)预测HA的潜在治疗药物。结果:HA的miRNA-mRNA负调控网络中包含5个miRNA,has-mir-1246、has-mir-3197、has-mir-3620和has-mir-30c-1表达上调，has-mir-570表达下调，对应负调控9个mRNA表达下调，5个mRNA表达上调。EpiMed平台预测到245种处方药物，CADD筛选出47种药物，综合评估后得到4种候选药物(地高辛、安西奈德、依托泊苷和阿奇霉素),4种候选药物与5个DEmiRNA均产生多条氢键相互作用力。结论:本研究构建HA miRNA-mRNA负调控网络，并预测得到4种靶向miRNA的潜在治疗药物。

关键词

血友病A / miRNA-mRNA调控网络 / 分子对接 / EpiMed / 药物预测