基于全基因组序列的117株肺炎克雷伯菌分子特征及表型分析

摘要

目的:基于全基因组测序技术，分析肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)的分子特征与表型特征，为预防高毒力耐药株流行及临床治疗提供依据。方法:收集江苏省某医院2023年2月至2024年2月的117株KP,进行抗菌药物敏感性试验和全基因组测序，明确菌株耐药表型、高黏表型，解析荚膜血清型、多位点序列分型、毒力基因与耐药基因携带情况。结果:菌株对氨苄西林、多西环素耐药率较高，分别为98.7%、41.0%;对头孢类抗菌药物耐药率为1.3%～16.5%;多重耐药菌检出率23.9%。共检出13类67个耐药基因，其中4株携带碳青霉烯类耐药基因。主要荚膜血清型为K1、K2型，合计占24.0%;O1为主要O抗原型，占52.1%。117株菌分属67个序列型(ST),占比>5.0%的为ST23、ST412、ST29、ST111。气杆菌素(Aerobactin,Aer)、耶尔森菌素(Yersiniabactin,Ybt)、大肠杆菌素(Colibactin,Clb)、沙门菌素(Salmochelin,Sal)、黏液表型调节因子RmpADC和RmpA2携带率分别为44.4%、47.9%、11.1%、54.7%、55.6%和29.9%;所有ST23型菌株均携带全套核心毒力基因。高黏表型菌株占28.2%,较非高黏表型菌株携带更多毒力基因(P<0.05)。结论:该医院分离的KP对氨苄西林、多西环素耐药率较高，对其他常用抗菌药物耐药率整体偏低，未出现单一克隆群、血清型或序列型的优势流行；携带多毒力基因的ST23型为相对优势株，存在向耐碳青霉烯类菌株演化的潜在风险，需持续监测。

关键词

肺炎克雷伯菌 / 全基因组测序 / 毒力基因 / 耐药表型 / 高黏表型 / 分子特征