辣椒CaFLK基因克隆及表达分析

摘要

[目的]本文旨在初步研究CaFLK基因在辣椒中潜在的生物学功能。[方法]以‘晋椒204’为试验材料，采用PCR技术进行CaFLK基因及其启动子序列的克隆，并运用生物信息学手段对所获序列展开系统分析，同时对不同组织中该基因的转录水平差异以及各类胁迫下其表达量的动态变化进行分析。[结果]克隆得到CaFLK基因全长1452 bp，编码483个氨基酸残基，含有3个KH保守结构域；理化性质分析表明该蛋白的分子量为51.75 kDa，等电点为4.83，为酸性蛋白，不稳定系数为59.18，为不稳定蛋白，亲水性指数4.83，为亲水性蛋白；该蛋白含有38个磷酸化位点、2个N-糖基化位点；该蛋白缺乏信号肽及跨膜结构域，无规则卷曲与α-螺旋作为关键构成部分在该基因的二、三级结构中占据主导地位；系统进化结果表明CaFLK与番茄、多疣茄、枸杞、烟草等茄科作物的同源性达95%；克隆得到2000 bp CaFLK启动子序列，顺式作用元件预测发现该区域含有多种胁迫和激素响应元件；互作蛋白预测结果表明有5个和开花有关的蛋白与其互作；实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明CaFLK基因在叶中表达量较高，在低温、ABA和MeJA处理下有较高的表达水平。[结论]CaFLK基因受不同胁迫和激素调控，并可能与开花相关蛋白互作，研究结果为其功能鉴定提供了思路。

关键词

辣椒 / FLK基因 / 生物信息学 / 表达分析