水液相环境脯氨酸Ca(Ⅱ)配合物旋光异构的密度泛函理论研究

孟雪飞 ,  张雪娇 ,  刘芳 ,  胡燠铭 ,  陶思宇 ,  黄煜纯 ,  马宏源 ,  王佐成

武汉大学学报(理学版) ›› 2021, Vol. 67 ›› Issue (5) : 467 -477.

PDF (5057KB)
武汉大学学报(理学版) ›› 2021, Vol. 67 ›› Issue (5) : 467 -477. DOI: 10.14188/j.1671-8836.2020.0300
其他

水液相环境脯氨酸Ca(Ⅱ)配合物旋光异构的密度泛函理论研究

作者信息 +

Density Function Theoretical Study on the Optical Isomerism of Proline Ca(Ⅱ) Complex in Water-Liquid Phase Environment

Author information +
文章历史 +
PDF (5177K)

摘要

采用基于密度泛函理论(DFT)的M06-2X和MN15方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相环境两性S-型脯氨酸(S-Pro)与Ca2+配合物(S-Pro·Ca2+)的旋光异构。考察了S-Pro·Ca2+在3个反应通道a、b和c的旋光异构过程:a通道是以羰基氧为质子迁移媒介;b通道是α-C上的质子先迁移至羰基氧,然后氨基氮上的质子在纸面内向α-C迁移;c通道是以羰基氧和氨基氮为质子迁移媒介。势能面研究表明:隐性溶剂效应下c通道明显具有优势,决速步能垒为221.4 kJ/mol;显性溶剂效应下c通道略具优势,决速步能垒降到131.2 kJ/mol。结果表明,脯氨酸钙在水液相环境只能很少量地消旋,其用于生命体同补脯氨酸和钙离子具有较好的安全性。

Abstract

The optical isomerism of amphoteric S-proline(S-Pro) and Ca2+ complexes(S-pro·Ca2+) has been studied in water- liquid phase environment by means of M06-2X and MN15 methods based on density functional theory and SMD model method of self-consistent reaction field theory. The optical isomerism of S-Pro·Ca2+ in three reaction channels has been investigated. Channel a uses the carbonyl O atom as the medium of protolysis. In channel b, the proton on α-C transfers to the carbonyl O atom, then the proton of amino group N atom transfers to α-C from inside the paper. Channel c uses the carbonyl O atom and the amino group N atom as the medium of protolysis. The potential energy surface shows that channel c has the most advantages under the effect of recessive solvent, and the energy barrier of the rate-determining step is 221.4 kJ/mol; channel c has the most advantages under the dominant solvent effect, and the energy barrier of the rate-determining step is reduced to 131.2 kJ/mol. The results show that S-Pro·Ca2+ can racemize with only a small amount in the water-liquid environment, and it is relatively safe to be used to supply proline and Ca2+ for life simultaneously.

Graphical abstract

关键词

氨基酸金属配合物 / 密度泛函理论 / 自洽反应场理论 / 旋光异构 / 过渡态 / 能垒

Key words

amino acid metal complex / density functional theory (DFT) / self-consistent reaction field theory / optical isomerism / transition state / energy barrier

引用本文

引用格式 ▾
孟雪飞,张雪娇,刘芳,胡燠铭,陶思宇,黄煜纯,马宏源,王佐成. 水液相环境脯氨酸Ca(Ⅱ)配合物旋光异构的密度泛函理论研究[J]. 武汉大学学报(理学版), 2021, 67(5): 467-477 DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0300

登录浏览全文

4963

注册一个新账户 忘记密码

0  引 言

脯氨酸(proline,Pro)是蛋白质的重要成分,其手性特征使其金属配合物也具有手性。Pro有S-Pro和R-Pro两种构型,根据旋光作用分为左-脯氨酸(L-Pro)和右-脯氨酸(D-Pro)。L-Pro在生命体内具有生物活性,有促进软骨修复和合成胶原蛋白的作用1,过量的D-Pro会影响健康2

钙是生命体重要的宏量元素,以二价钙的形式存在,对形成骨骼、保证心脏规律跳动及协调酸碱平衡都有重要作用3~5。人体吸收食物中的钙是通过钙离子在小肠与氨基酸螯合后,再被整体吸收6,因此,氨基酸钙用于补钙更易被生命体吸收,在临床、食品及畜牧业中已经被应用7

不同旋光性的手性分子对生命体作用迥异,氨基酸配合物,左旋体是优构体。因此,研究氨基酸及其金属配合物的旋光异构有重要意义。文献[89]对Pro旋光异构的研究表明,气相Pro不能消旋,水分子(簇)的催化可使其缓慢地消旋,碱性环境有利于Pro的消旋。文献[10~17]的研究表明,气相α-丙氨酸(α-Ala)与Fe2+、Cu2+、Mg2+、Na+等形成的配合物很难消旋,水汽环境下水分子(簇)对丙氨酸金属配合物的消旋反应有催化作用,可使其痕量地消旋。文献[18]的理论研究表明,气相脯氨酸Ca2+不能旋光异构,水分子(簇)的催化能使脯氨酸钙痕量地消旋。

生命体内分子的反应多数在水环境下进行。文献[19~21]的研究表明,水液相环境α-Ala与Zn2+、Fe2+和Mg2+的配合物只能痕量或微量地消旋,可安全地用于生命体同补α-Ala与锌、铁、镁等。为了考察生命体同补脯氨酸和钙的安全性,本文研究了水液相环境的脯氨酸钙旋光异构。

1  模型选取及计算方法

计算表明,水液相下两性Pro比中性Pro与Ca2+双齿配位构象稳定,前者相对后者的能量是-40.5 kJ/mol,后者向前者异构的能垒为36.5 kJ/mol。因此,将两性Pro与Ca2+双齿配合物作为反应底物,讨论其旋光异构。在SMD22/M06-2X23/6-311+G(d, p)水平全优化单重态势能面上的驻点结构(自旋多重度测算表明,本研究体系在单重态最稳定),通过对过渡态24虚频振动模式的分析及内禀反应坐标(IRC)计算25,对过渡态与稳定点的关联性给予确认。为计算出较精确的反应势能面,在SMD/ MN1526/ 6-311++G(2df,pd)水平计算单点能,通过自由能热校正获得驻点的高水平自由能(自由能热校正在298.15 K及1个大气压下进行,总自由能是自由能热校正加上单点能)。S-Pro与Ca2+的配合物S-Pro·Ca2+记作S-P,6个水分子与I1a(b)(a和b通道的第一个中间体产物)的钙配位得到的配合物记作I1a(b)←6H2O,I1a(b)←6H2O再与纸面外(内)的二聚水氢键作用的络合物记作I1a(b)←6H2O·(H2O)2m(n)(配合物、络合物分子中的氢键用虚线表示,m和n分别表示2聚水(H2O)2在底物的前面和后面),其他体系标记法相似。计算采用Gaussian16程序27完成。

2  结果与讨论

将文献[18]的气相两性Pro与Ca2+双齿配位构象作为初始猜测,优化的水液相环境脯氨酸钙手性对映体见图1。分析图1可知,S-P向R-P异构有多种途径:可先进行α-H向羰基O迁移,然后分别进行质子从羰基O在纸面内向α-C迁移(a通道)和氨基H在纸面内向α-C迁移(b通道);也可先进行氨基H向羰基O迁移,然后进行α-H以氨基N为桥迁移至α-C的另一侧(c通道);还可先进行五元杂环在纸面内外侧翻转异构,然后进行质子迁移(d、e、f等通道)。计算表明,五元环翻转异构或先或后进行对质子迁移能垒影响很小,为节省篇幅,只考察先进行质子迁移的反应通道a、b和c。

对非质子转移反应,水分子(簇)与反应物的氢键作用对能垒影响不大,只需考虑隐性水溶剂效应(溶剂极性的作用)。对于质子迁移反应,水分子(簇)作为质子转移媒介可能会显著地改变反应能垒,水分子与Ca2+配位也可能会影响反应能垒,因此,研究质子转移要兼顾溶剂极性和水分子(簇)的共同作用,即显性水溶剂效应。为清晰地呈现水液相环境S-P向R-P异构的历程,得到水分子(簇)所起的作用及S-P向R-P异构的清晰路径,先讨论隐性水溶剂效应下S-P的旋光异构,然后再讨论显性水溶剂效应下S-P向R-P异构。

2.1 隐性溶剂效应下S-P的旋光异构

S-P旋光异构的历程见图2图3,反应的势能面见图4。a、b通道具有共同的第1和第2基元反应,放在同一节讨论,而后讨论c通道。

2.1.1 a、b通道的旋光异构

共用的基元反应:

第1基元:反应底物S-P经9H从1C向8O迁移的过渡态T1a(b),异构到第1中间体I1a(b)。从S-P到T1a(b),1C—9H键从0.108 8 nm拉伸至0.148 9 nm,断裂,二面角2N—1C—5C—6C从117.9°变为120.7°。这些变化使T1a(b)产生了255.5 kJ/mol的内禀能垒。该能垒低于气相反应该基元的能垒279.4 kJ/mol18,原因是水溶剂的作用使S-P异构到T1a(b)过程中,C—H键的拉伸幅度及骨架形变减小(气相C—H键拉伸0.042 5 nm,骨架形变是14.8°18)所导致。

第2基元:I1a(b)经五元环的亚甲基14H—4C—15H翻转异构的过渡态T2a(b),异构到第2中间体I2a(b)。从I1a(b)到T2a(b),二面角4C—3C—2N—1C从-30.1°变为-21.9°,二面角较小的形变需要很少的能量,T2a(b)产生的内禀能垒仅8.8 kJ/mol。

接下来的反应历程为a、b通道专属的基元反应。

2.1.1.1 a通道专属基元反应

第3基元:I2a(b)经和T1a(b)镜像对称的过渡态T3a,异构成R-Pro与钙的配合物R-Pa。至此,S-P在a通道实现旋光异构。结构分析表明,R-PaS-P的手性对映体。从I2a(b)到T3a,8O—9H键从0.096 6 nm拉伸至0.120 9 nm,断裂,T3a产生的内禀能垒为144.3 kJ/mol。该能垒比T2a(b)产生的内禀能垒低很多,原因有两个:一是此基元O—H键的拉伸比第2基元C—H键的拉伸幅度小很多;二是从I2a(b)到T3a过程,1C从sp2杂化向sp3杂化过渡,体系释放能量。与气相的此基元反应(能垒为181.6 kJ/mol18)比较可知,水溶剂对此基元反应起催化作用,其原因是,与文献[18]比较,水溶剂效应使从I2a(b)到T3a过程的O—H键拉伸幅度减小了。

2.1.1.2 b通道专属反应

第3基元:I2a(b)经11H在纸面内侧从2N向1C迁移的过渡态T3b,异构成R-I3bS-P在b通道实现旋光异构。从I2a(b)到T3b,2N—11H键从0.102 3拉伸至0.123 6 nm,断裂,T3b产生的内禀能垒为158.5 kJ/mol。这与气相下此基元的内禀能垒224.0 kJ/mol18相比显著降低,说明水溶剂对此基元有催化作用。原因之一是水溶剂效应使从I2a(b)到T3b过程的2N—11H的拉伸幅度减小许多,原因之二是I2a(b)的偶极矩(19.528)小于T3b的偶极矩(23.556),极性水溶剂的作用使T3b变得相对稳定。

第4基元:R-I3b经6C—1C右视逆时针旋转的过渡态R-T4b,异构成R-I4b。从R-I3bR-T4b,二面角7O—6C—1C—2N从8.6°增加至104.5°,化学键内旋转所需能量很少,R-T4b产生的内禀能垒为16.9 kJ/mol。

第5基元:R-I4b经9H从8O向2N迁移的过渡态R-T5b,异构成与S-P镜像对称的产物R-Pb。从R-I4bR-T5b,8O—9H键从0.097 3 nm拉伸至0.126 4 nm,断裂,R-T5b产生的内禀能垒为46.4 kJ/mol。此基元与a通道第3基元O—H键拉伸幅度基本相同,但此基元的能垒却低很多,原因是此基元的质子迁移方向是逆偶极矩方向,体系的电场力对质子迁移做正功。

2.1.2 c通道的旋光异构

第1基元:S-P经11H从2N向7O迁移的过渡态S-T1c,异构成第1中间体S-I1c。从S-P到S-T1c,2N—11H键从0.102 9 nm拉伸至0.138 3 nm,断裂,S-T1c产生了30.1 kJ/mol的内禀能垒。

第2基元:S-I1c经7O—6C俯视逆(或顺)时针内旋转的过渡态S-T2mcS-T2nc(m和n分别表示11H在纸面外和纸面内从羧基外侧旋转到内侧),异构到第2中间体S-I2c。从S-I1cS-T2mc,二面角11H—7O—6C—1C从0.2°增加至98.0°,化学键内旋转所需能量不多,S-T2mc产生的内禀能垒为58.9 kJ/mol。与之相似,S-T2nc产生的内禀能垒为59.3 kJ/mol。

第3基元:S-I2c经亚氨基翻转的过渡态S-T3c,10H从纸面外翻转到纸面内侧,异构成S-I3c,从S-I2cS-T3c,二面角10H—2N—3C—1C从-113.1°变为-179.1°,非骨架形变所需能量很少,S-T3c产生的内禀能垒仅9.5 kJ/mol。

第4基元:S-I3c经9H从1C向2N迁移的过渡态T4c,异构成I4c。从S-I3c到T4c,1C—9H键从0.109 1 nm拉伸至0.129 6 nm,断裂,二面角2N—1C—5C—6C从123.1°变为143.9°。这些变化使T4c产生了221.4 kJ/mol的内禀能垒。该基元能垒小于a通道第1基元的能垒,原因是此基元中间体反应物到过渡态1C—9H键的拉伸幅度小。

第5基元:I4c经与a通道第2基元相似的过渡态T5c,亚甲基14H—4C—15H翻转异构,得到第5中间体I5c。从I4c到T5c,二面角4C—3C—2N—1C从-32.5°变为-22.1°,T5c产生的内禀能垒为15.3 kJ/mol。结构分析表明,此基元实现了I4c的镜像对称异构。

下面的基元反应与前面的基元反应关于T5c镜像对称,只做简单讨论。

第6基元:该基元与第4基元对称,I5c经10H从2N向1C迁移的过渡态T6c,异构到第6中间体R-I6c。至此,S-P实现了旋光异构。从I5c到T6c,2N—10H键从0.102 3拉伸至0.123 3 nm,断裂,T6c产生的内禀能垒为162.4 kJ/mol。

第7基元:该基元与第3基元对称,R-I6c经亚氨基翻转的过渡态R-T7c,9H从纸面外翻转到纸面内侧,异构成中间体R-I7cR-T7c产生的内禀能垒为7.5 kJ/mol。

第8基元:该基元与第2基元对称,R-I7c经7O—6C内旋转的过渡态R-T8mc(或R-T8nc),异构到中间体R-I8cR-T8mc产生的内禀能垒为38.3 kJ/mol,R-T8nc产生的内禀能垒为38.7 kJ/mol。

第9基元:该基元与第1基元对称,R-I8c经11H从7O向2N迁移的过渡态R-T9c,异构到产物配合物R-Pc。至此,S-P实现了手性对映体转变。R-T9c产生的内禀能垒为3.4 kJ/mol,远小于第一基元的S-P经11H从2N向7O迁移的过渡态S-T1c产生的能垒,原因是此基元的质子是逆偶极矩方向迁移,体系的电场力助力了质子的迁移。

图4可以看出,S-P在c通道旋光异构具有优势,在a和b通道旋光异构处于劣势。比较而言,b通道比a通道第2决速步能垒高,最具劣势。优势通道的决速步能垒为221.4 kJ/mol,来自过渡态T4c,该能垒远高于反应的极限能垒167.0 kJ/mol28,说明隐性溶剂效应下S-P旋光异构反应不能发生。由于能垒小于40.0 kJ/mol时反应可通过分子间的碰撞实现28,说明水液相下反应物是S-P和S-I1c共存,前者分布高;产物是R-I8cR-Pc共存,后者分布高。图4结合图3可以看出,a和c通道展现了手性对映体转变的内在与外在美。

2.2 显性溶剂效应下S-P的旋光异构

水分子与底物的配位键强于氢键,水分子要先与Ca2+配位饱和,然后再与底物氢键作用。Ca2+的配位数最多是8,底物的Ca2+已与羰基O二配位,再与Ca2+配位的水分子数是6。计算表明,质子在α-C、羰基O或氨基N间迁移,二聚水和三聚水的催化作用相差很小,它们的催化作用远大于单个水分子,因此,仅讨论2个水分子簇作为H迁移媒介的情况。对于质子在氨基N和羰基O间的迁移,由于空间的限制,二聚水和三聚水作媒介,反应能垒会急剧升高,因此,仅讨论没有水分子和单个水分子作媒介的情况。对于五元环的异构,仅讨论水分子与Ca2+配位的情况。篇幅所限,对S-P在a通道旋光异构的完整过程进行讨论,在b和c通道的旋光异构仅讨论质子转移过程。

2.2.1 显性溶剂效应下S-P在a和b通道的旋光异构

水分子(簇)作用下,S-P在a和b通道旋光异构共同的基元反应及a通道专属基元反应历程见图5,b通道第3基元反应历程见图6,反应的自由能势能面见图7

2.2.1.1 a通道

第1基元:S-P与6个水分子配位,二聚水在纸面外再与其α-C和8O氢键作用,得到反应物S-Pa(b)←6H2O·(H2O)2m,经二聚水做质子转移媒介的过渡态T1_1a(b)←6H2O·(H2O)2m,实现了质子从1C向8O的净迁移,异构成I1_1a(b)←6H2O·(H2O)2m。从S-Pa(b)←6H2O·(H2O)2m到T1a(b)←6H2O·(H2O)2m,1C—9H键从0.108 9 nm拉伸至0.135 3 nm,断裂、37O—39H和40O—42H分别从0.097 6和0.097 9 nm拉伸断裂;二面角2N—1C—5C—6C从117.2°增加至119.9°。3个化学键的拉伸断裂需一定的能量,T1a(b)←6H2O·(H2O)2m产生的内禀能垒为139.3 kJ/mol。对比水汽相此基元反应能垒149.1 kJ/mol18,该能垒略有降低,说明水溶剂起到了较弱的催化作用。与前文T1a(b)产生的内禀能垒255.5 kJ/mol相比较可知,水分子簇对此基元有较好的催化作用。其原因是T1a(b)←6H2O·(H2O)2m的八元环存在较强的氢键且共面程度较好,导致八元环过渡态T1a(b)←6H2O·(H2O)2m相对稳定。

第2基元:I1a(b)←6H2O经五元环异构的过渡态T2a(b)←6H2O,二面角4C—3C—2N—1C从-30.7°变为30.7°,异构成I2a(b)←6H2O。从I1a(b)←6H2O到T2a(b)←6H2O,4C—3C—2N—1C从-30.7°增加至0.1°,T2a(b)←6H2O产生的内禀能垒10.6 kJ/mol,与T2a(b)产生的内禀能垒8.8 kJ/mol相差不多,说明水分子与Ca2+的配位对R-基形变能垒的影响不大。与文献[19]比较可知,水溶剂对此基元反应基本无催化作用,原因是I1a(b)←6H2O和T2a(b)←6H2O的偶极矩基本相同,极性水溶剂效应不明显。

第3基元,I2a←6H2O的1C、42H和32H与二聚水氢键作用,形成的中间体I2a←6H2O·(H2O)2n,经二聚水作质子转移媒介的过渡态T3a←6H2O·(H2O)2n,实现了质子在纸面里从8O向1C的净迁移,异构成产物R-Pa←6H2O·(H2O)2n,实现旋光异构。从I2a←6H2O·(H2O)2n到T3a←6H2O·(H2O)2n,8O—42H、40O—39H和37O—9H键长分别从0.098 5、0.097 3 和0.097 6 nm拉伸至0.102 2、0.101 0和0.126 1 nm。这些变化使T3a←6H2O·(H2O)2n产生了32.2 kJ/mol的内禀能垒。

结构分析表明,显性溶剂效应下,S-P在a通道的驻点构象关于T2a(b)←6H2O镜像对称。

2.2.1.2 b通道

第3基元:I2_1b与6个水分子配位,二聚水与其α-C和氨基氮2N氢键作用,得到反应物复合物I2b←6H2O·(H2O)2n,再经二聚水做质子转移媒介的过渡态T3b←6H2O·(H2O)2n,实现质子从1C向2N的净迁移,异构成中间体R-I3b←6H2O·(H2O)2n。从I2b←6H2O·(H2O)2n到T3b←6H2O·(H2O)2n,2N—11H、37O—39H和40O—41H键长分别从0.103 1、0.097 2和0.097 0 nm拉伸至0.167 0、0.143 8和0.109 2 nm。3个化学键的拉伸、断裂使T3b←6H2O·(H2O)2n产生了100.9 kJ/mol的内禀能垒。与前文T3b产生的158.5 kJ/mol的内禀能垒相比,水分子簇对此基元有较好的催化作用。

图7可以看出,水分子(簇)作用下S-P在a、b通道旋光异构决速步的能垒为139.3 kJ/mol,远高于温和反应能垒80.0 kJ/mol28,说明显性溶剂效应下S-P在a通道的旋光异构只能缓慢进行。

2.2.2 显性溶剂效应下S-P在c通道的质子迁移反应

显性溶剂效应下S-P在c通道的质子迁移反应是第1、4、6和9基元,根据计算,与隐性溶剂效应的情况相似,第6和第9基元分别与第4和第1基元镜像对称。为节省篇幅,此处仅讨论第1和4基元,反应历程见图8,反应的势能面见图9

2.2.2.1 第1基元

第1基元反应分单质子迁移和水分子作媒介的质子迁移两种情形讨论。

1) 单质子迁移。S-Pc←6H2O经11H从2N向7O迁移的过渡态S-T1c←6H2O,异构成S-I1c←6H2O。从S-Pc←6H2O到S-T1c←6H2O,2N—11H键从0.103 4 nm拉伸至0.140 1 nm,断裂,产生了4.1 kJ/mol的内禀能垒。此能垒与没有水分子与Ca2+配位时S-T1c的能垒30.1 kJ/mol相比大幅降低,说明水分子与Ca2+配位对此基元反应起到了极好的催化作用。原因是水分子的配位使S-Pc中2N—11H的伸缩振动频率从3 383.5 cm-1红移至3 295.5 cm-1,2N—11H键被很好地活化。

2) 水分子作媒介的质子迁移。S-Pc←6H2O·H2O经双质子迁移的过渡态S-T1c←6H2O·H2O,实现了质子从5N向15O的净迁移,异构成S-I1c←6H2O·H2O。从S-Pc←6H2O·H2O到S-T1c←6H2O·H2O,2N—11H和37O—39H分别从0.102 7和0.097 2 nm拉伸至0.143 6和0.119 8 nm,断裂,产生了58.5 kJ/mol的内禀能垒。此能垒与单质子迁移时S-T1c←6H2O产生的能垒4.1 kJ/mol相比较极显著地增加,说明水分子做质子转移媒介对此基元反应有显著的负催化作用。原因是水分子与S-Pc←6H2O氨基N的氢键作用使2N—11H的伸缩振动频率从3 295.5 cm-1蓝移至3 416.7 cm-1,严重钝化了2N—11H键。58.5 kJ/mol的能垒小于温和反应能垒80.0 kJ/mol28许多,说明此基元反应容易进行。

计算表明,S-Pc←6H2O·H2O中H2O与S-Pc←6H2O的氢键能是12.4 kJ/mol,H2O很容易通过碰撞过程从S-Pc←6H2O·H2O分子上解离,形成S-Pc←6H2O。因此,S-Pc←6H2O经S-T1c←6H2O异构成S-I1c←6H2O的单质子迁移过程占绝对优势。

2.2.2.2 第4基元

S-I3c是Ca与1个O配位,再与7个H2O配位形成S-I3c←7H2O,Ca3+满配后,(H2O)2再与α-H和N氢键作用,(H2O)2和与Ca配位的H2O形成稳定的氢键网络,得到中间体反应物S-I3c←7H2O·(H2O)2m。S-I3c←7H2O·(H2O)2m经3质子协同非同步迁移的过渡态T4c←7H2O·(H2O)2m,实现了H从α-C向N净迁移,异构成I4c←7H2O·(H2O)2m。从S-I3c←7H2O·(H2O)2m到T4c←7H2O·(H2O)2m,1C—9H从0.109 3 nm拉伸至0.132 3 nm,40O—41H和43O—45H键断裂,水分子间的部分氢键断裂,这些变化使T4c←7H2O·(H2O)2m产生了131.2 kJ/mol的内禀能垒。该能垒与T4c产生的内禀能垒221.4 kJ/mol相比显著下降,说明水分子(簇)的作用对此基元反应有极好的催化作用。

第6与第4基元镜像对称,第6基元正反应的能垒与第4基元负反应的能垒相同,为59.3 kJ/mol。第9与第1基元镜像对称,第9基元正反应能垒与第1基元负反应的能垒相同,为0.9 kJ/mol。结合图9可知,水分子(簇)作用下S-P在c通道旋光异构决速步的能垒为131.2 kJ/mol,远高于温和反应能垒80.0 kJ/mol28,说明显性溶剂效应下S-P在c通道的旋光异构只能缓慢进行。结合图7图9可知,显性溶剂效应下S-P在c通道的旋光异构只有微弱的优势。

3  结 论

本文在SMD/MN15/6-311++G(2df,pd)//SMD/M06-2X/6-311+G(d,p)双水平,研究了Ca2+与两性Pro分子配合物在水液相环境的旋光异构,得到如下结论:1) 隐性溶剂效应下,以氨基N为H迁移桥梁的c通道具有优势,决速步能垒为221.4 kJ/mol;以羰基O为H迁移媒介的a通道以及α-C迁移至羰基O后,氨基N上的H再向α-C迁移的b通道处于劣势,决速步能垒为255.5 kJ/mol;2) 显性溶剂效应下c通道略具优势,决速步能垒降至131.2 kJ/mol;a和b通道略处于劣势,决速步能垒降到139.3 kJ/mol;3) 水分子(簇)对H迁移反应有正催化作用或有负催化作用。上述结果表明,脯氨酸钙在水液相环境消旋很缓慢,其用于生命体同补脯氨酸和钙具有较好的安全性。

参考文献

[1]

漆剑. L-脯氨酸和L-缬氨酸构型转换的研究[D]. 南昌: 南昌大学, 2006. DOI: 10.7666/d.y928803 .

[2]

QI J. Study on Configuration Transformation of L-Proline and L-Valine [D]. Nanchang:Nanchang University, 2006. DOI: 10.7666/d.y928803(Ch ).

[3]

HAMASE KINOUE TMORIKAWA Aet al. Determination of free D-proline and D-leucine in the brains of mutant mice lacking D-amino acid oxidase activity [J]. Analytical Biochemistry2001298(2):253-258. DOI: 10.1006/abio.2001.5382 .

[4]

李铭,邹颖,郭寒,. 钙离子在内质网应激中的作用[J]. 动物医学进展201839(9): 112-116. DOI: 10.16437/j.cnki.1007-5038.2018.09.021 .

[5]

LI MZOU YGUO Het al. Effect of calcium ion on endoplasmic reticulum stress [J]. Progress in Veterinary Medicine201839(9): 112-116. DOI: 10.16437/j.cnki.1007-5038.2018.09.021 (Ch ).

[6]

王云堂. 钙在植物营养中的作用分析[J]. 种子科技201937(6):32-33. DOI:10.3969/j.issn. 1005-2690. 2019.06.031 .

[7]

WANG Y T. Analysis of the role of calcium in plant nutrition [J]. Seed Science & Technology201937(6): 32-33. DOI:10.3969/j.issn.1005-2690.2019.06.031(Ch ).

[8]

陈瑞仪, 谭剑斌, 周轶琳, . 氨基酸螯合钙增加骨密度作用的实验研究[J]. 氨基酸和生物资源201133(1): 60-62. DOI:10.14188/j.ajsh.2011.01.012 .

[9]

CHEN R YTAN J BZHOU Y Let al. Experimental study on raising bone density by calcium amino acid chelate compound in rats [J]. Amino Acids and Biotic Resources201133(1): 60-62. DOI:10.14188/j.ajsh.2011.01.012(Ch ).

[10]

梁媛, 王昕, 赵婷婷, . 食品中钙吸收的机理与钙体外转化新方法探讨[J]. 食品研究与开发201637(4): 195-199. DOI:10.3969/j.issn.1005-6521.2016.04.048 .

[11]

LIANG YWANG XZHAO T Tet al. Mechanism and method of calcium absorption in food and discussion of transforming calcium in vitro [J]. Food Research And Development201637(4): 195-199. DOI:10.3969/j.issn.1005-6521.2016.04.048(Ch ).

[12]

薛荣涛,李翠芹,何腊平.复合氨基酸螯合钙的研究进展 [J]. 食品工业科技201435(21): 390-394. DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2014.21.076 .

[13]

XUE R TLI C QHE L P. Research progress in compound amino acid chelated calcium [J]. Science and Technology of Food Industry201435(21): 390-394. DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2014.21.076(Ch ).

[14]

王佐成, 喻小继, 闫红彦, . 脯氨酸分子的手性转变机理及水的作用[J]. 武汉大学学报(理学版)201763(4): 317-324. DOI:10.14188/j.1671-8836.2017.04.006 .

[15]

WANG Z CYU X JYAN H Yet al. Chiral enantiomers transformation of proline molecule and effect of water [J]. Journal of Wuhan University (Natural Science Edition)201763(4): 317-324. DOI:10.14188/j.1671-8836.2017.04.006(Ch ).

[16]

刘军,潘宇,李加欢, . 水液相环境下两性脯氨酸分子旋光异构的理论研究[J].武汉大学学报(理学版)202066(6): 572-582. DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0167 .

[17]

LIU JPAN YLI J Het al. Theoretical study on optical isomerization of amphoteric proline molecule in aqueous-liquid environment [J]. Journal of Wuhan University (Science Edition)202066(6): 572-582. DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0167(Ch ).

[18]

李冰,潘宇,徐锐英,.气相环境下Cu2+催化α-Ala手性对映体转变的机理[J]. 武汉大学学报(理学版)201965(6): 621-628. DOI: 10.14188/j.1671-8836.2019.06.013 .

[19]

LI BPAN Y, XV R Y, et al. Mechanism of chiral enantiomer transition of α-Ala catalyzed by Cu2+ in gas phase environment[J]. Journal of Wuhan University(Science Edition)201965(6): 621-628.DOI: 10.14188/j.1671-8836.2019.06.013(Ch ).

[20]

李冰, 陈静思, 徐锐英, . 气相环境下Na+催化丙氨酸分子手性转变的机理 [J]. 复旦学报(自然科学版)202059(4): 495-504. DOI: 10.15943/j.cnki.fdxb-jns.2020.04.015 .

[21]

LI BCHEN J SXU R Yet al. Mechanism of chiral transition of alanine catalyzed by Na+ in gas phase [J]. Journal of Fudan University (Natural Science)202059(4): 495-504. DOI: 10.15943/j. cnki. fdxb- jns.2020.04.015(Ch ).

[22]

车立新, 张雪娇, 刘芳, . 气相α-丙氨酸二价锌配合物手性转变的密度泛函理论研究[J]. 云南大学学报(自然科学版)202042(5): 966-976. DOI:10.7540/j.ynu.20200038 .

[23]

CHE L XZHANG X JLIU Fet al. Chiral transition mechanism of Zn(Ⅱ) and α-Ala complexes in gas phase: A density functional theory study [J]. Journal of Yunnan University (Natural Sciences Edition)202042(5): 966-976. DOI:10.7540/j.ynu.20200038(Ch ).

[24]

张雪娇, 李冰, 姜春旭, . 气相环境下丙氨酸Mn(Ⅱ)配合物的手性转变机理[J]. 武汉大学学报(理学版)202066(4): 345-353. DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0024 .

[25]

ZHANG X JLI BJIANG C Xet al. Chiral transition mechanism of Mn(Ⅱ) and alanine complexes in gas phase environment [J]. Journal of Wuhan University (Natural Science Edition)202066(4): 345-353. DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0024(Ch ).

[26]

刘芳, 马宏源, 潘宇, . 气相环境下K+催化丙氨酸分子手性对映体转变的机理 [J]. 厦门大学学报(自然科学版)202059(6): 912-920. DOI:10.6043/j.issn.0438-0479.201910017 .

[27]

LIU FMA H YPAN Yet al. Mechanism of alanine chiral enantiomer transition catalyzed by K+ in gas phase [J]. Journal of Xiamen University (Natural Science)202059(6): 912-920. DOI:10.6043/j.issn. 0438-0479.201910017(Ch ).

[28]

姜春旭,陈凤清,张雪娇,.基于密度泛函理论的气相下α-Ala·Fe2+配合物手性转变机理 [J]. 复旦学报(自然科学版)202059(5): 690-701. DOI:10.15943/j.cnki.fdxb-jns.2020.05.014 .

[29]

JIANG C XCHEN F QZHANG X Jet al. Chiral transition mechanism of Fe2+ and α-Ala complexes in gas phase based on density functional theory [J]. Journal of Fudan University (Natural Sciences)202059(5):690-701. DOI:10.15943/j.cnki.fdxb-jns.2020.05.014(Ch ).

[30]

张雪娇, 刘芳, 吴梓昊, . 丙氨酸Mg2+配合物的手性转变机理水分子(簇)的作用及水溶剂效应[J]. 中山大学学报(自然科学版)202059(5): 156-168. DOI:10.13471/j.cnki.acta.snus.2020.02.02.2020c003 .

[31]

ZHANG X JLIU FWU Z Het al. Chiral transition mechanism of Mg2+and Ala complexes and effect of water molecules (clusters) and water solvents [J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni202059(5): 156-168. DOI:10.13471/j.cnki.acta.snus.2020.02.02.2020c003(Ch ).

[32]

徐锐英, 刘芳, 马宏源, . 气相环境下丙氨酸Ca2+配合物的手性转变机理及水分子的催化作用[J]. 浙江大学学报(理学版)202047(5): 630-641. DOI:10.3785/j.issn.1008-9497.2020.05.015 .

[33]

XU R YLIU FMA H Yet al. Chiral transition mechanism of Ala and Ca2+ complexes in gas phase and catalysis of water molecules [J]. Journal of Zhejiang University (Science Edition)202047(5): 630-641. DOI:10.3785/j.issn.1008-9497.2020.05.015(Ch ).

[34]

黄煜纯,张雪娇,刘芳,. 气相脯氨酸Ca2+配合物旋光异构及水分子(簇)催化的机理[J]. 武汉大学学报(理学版)202167(5):478-488.DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0287 .

[35]

HUANG Y CZHANG X JLIU Fet al. Optical isomerism mechanism of proline and Ca2+ complexes in gas phase and catalysis of water molecules(clusters) [J]. Journal of Wuhan University(Science Edition)202167(5):478-488.DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0287(Ch ).

[36]

苏丹,孙玉锋,郝成欣,.水液相环境下α-丙氨酸二价锌配合物的手性转变机理[J]. 中山大学学报(自然科学版)202059(6):50-59. DOI: 10.13471/j.cnki.acta.snus.2020.04.29.2020C011 .

[37]

SU DSUN Y FHAO C Xet al. Chiral transition mechanism of α-alanine divalent zinc complex in water/liquid phase environment [J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni202059(6):50-59. DOI: 10.13471/j.cnki.acta.snus.2020.04.29.2020C011(Ch ).

[38]

刘军, 姜春旭, 胡燠铭, . 水液相环境下两性α-丙氨酸Fe(Ⅱ)配合物的构型反转[J]. 武汉大学学报(理学版)202167(4): 375-385. DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0132 .

[39]

LIU JJIANG C XHU Y Met al. Configuration inversion of amphoteric α-alanine Fe(Ⅱ)complex in water-liquid phase environment[J]. Journal of Wuhan University (Natural Science Edition)202167(4): 375-385. DOI:10.14188/j.1671-8836.2020.0132(Ch ).

[40]

钱研,张雪娇,刘芳,.水液相环境两性α-丙氨酸Mg2+配合物旋光异构的理论研究[J]. 复旦学报(自然科学版)202059(6):712-721. DOI: 10.15943/j.cnki.fdxb-jns.2020.06.015 .

[41]

QIAN YZHANG X JLIU Fet al. Theoretical study on the optical isomerization of amphoteric α-alanine Mg2+ complex in water-liquid phase environment [J]. Journal of Fudan University (Natural Sciences)202059(6): 712-721. DOI: 10.15943/j.cnki.fdxb-jns.2020.06.015(Ch ).

[42]

MARENICH A VCRAMER C JTRUHLAR D G. Universal solvation model based on solute electron density and on a continuum model of the solvent defined by the bulk dielectric constant and atomic surface tensions [J]. The Journal of Physical Chemistry B2009113(18): 6378-6396. DOI:10.1021/ jp810292n .

[43]

HOHENSTEIN E GCHILL S TSHERRILL C D. Assessment of the performance of the M05-2X and M06-2X exchange-correlation functionals for noncovalent interactions in biomolecules [J]. Journal of Chemical Theory and Computation20084(12): 1996-2000. DOI:10.1021/ct800308k .

[44]

GARRETT B CTRUHLAR D G. Criterion of minimum state density in the transition state theory of bimolecular reactions [J]. The Journal of Chemical Physics197970(4): 1593-1598. DOI: 10.1063/1.437698 .

[45]

HRATCHIAN H PSCHLEGEL H B. Using hessian updating to increase the efficiency of a hessian based predictor-corrector reaction path following method [J]. Journal of Chemical Theory and Computation20051(1): 61-69. DOI:10.1021/ct0499783 .

[46]

YU H SHE XLI S Let al. MN15: A kohn-sham global-hybrid exchange-correlation density functional with broad accuracy for multi-reference and single-reference systems and noncovalent interactions [J]. Chemical Science20167(8):5032-5051.. DOI: 10.1039/c6sc00705h .

[47]

FRISCH M JTRUCKS G WSCHLEGEL H Bet al. Gaussian 16 Revision C.01[CP]. Pittsburgh: Gaussian Inc2019.

[48]

GORB LLESZCZYNSKI J. Intramolecular proton transfer in mono- and dihydrated tautomers of guanine: An ab initio post Hartree-Fock study [J]. Journal of the American Chemical Society1998120(20): 5024-5032. DOI:10.1021/ja972017w .

基金资助

吉林省教育厅科学研究规划项目(JJKH20200002KJ)

吉林省大学生创新项目(202010206066)

吉林省自然科学基金(20130101131JC)

AI Summary AI Mindmap
PDF (5057KB)

0

访问

0

被引

详细

导航
相关文章

AI思维导图

/