牦牛BTG2基因CDS区克隆分析及组织表达研究

摘要

【目的】克隆牦牛BTG2基因编码区（CDS区）,对其进行生物信息学分析和组织表达分析，为后续深入研究牦牛BTG2基因的生物学功能奠定基础。【方法】以美仁牦牛为研究对象，采集其心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织。提取脂肪组织总RNA,反转录获得cDNA。PCR克隆牦牛BTG2基因的CDS区，测序后进行生物信息学分析。利用RT-qPCR技术，分析BTG2基因在心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中的表达水平。【结果】牦牛BTG2基因的CDS区全长453 bp,共编码150个氨基酸；BTG2蛋白的分子式为C₇₄₈H₁₁₉₀N₂₀₈O₂₁₃S₈,分子质量为16 761.42 ku,原子总数为2 367个；不稳定性指数为48.51,是不稳定蛋白；理论等电点为9.14;主要分布于细胞核（占56.5%）和线粒体（占26.1%）;氨基酸序列的1～108位有1个BTG1域；总平均亲水系数为-0.123,是亲水蛋白；共有15个磷酸化位点；二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主；无跨膜结构且无信号肽区域；与10个蛋白存在互作关系。系统进化分析结果显示，美仁牦牛与野牦牛亲缘关系最近，与间蜂猴亲缘关系最远。RT-qPCR结果显示，BTG2在成年公牦牛的心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中均有表达，其中在脂肪组织和脾脏组织中表达水平较高，在肌肉和睾丸组织中表达水平较低。【结论】克隆了牦牛BTG2基因，对其进行了生物信息学分析，明确了其组织表达情况。

关键词

美仁牦牛 / BTG2基因 / 生物信息学分析 / 组织表达分析 / 系统进化