牦牛FABP4和FABP5基因克隆及生物信息和组织表达分析

摘要

【目的】探究FABP4和FABP5基因对牦牛脂肪酸的调控机制，提升牦牛肉品质。【方法】采用RT-PCR扩增牦牛FABP4和FABP5基因CDS序列，利用在线软件进行生物信息学分析，使用MEGA7.0构建系统发育进化树分析其同源性。采用实时荧光定量PCR检测FABP4和FABP5基因在心脏、肝脏、肺脏、肾脏、脂肪、肌肉和十二指肠中的表达水平，探究其在不同组织中的表达差异。【结果】牦牛FABP4、FABP5基因CDS序列全长分别为393和408 bp,分别编码130和135个氨基酸，基于FABP4和FABP5氨基酸序列相似性构建的系统进化树均显示，牦牛与美洲野牛的亲缘关系最近，其次是牛，与鸡的亲缘关系较远。FABP4和FABP5蛋白二级结构、三级结构以无规则卷曲和延伸链为主，无跨膜结构域和信号肽，推测其不是分泌蛋白，为稳定的亲水性蛋白。牦牛FABP4、FABP5氨基酸序列分别存在16和17个磷酸化位点，均以苏氨酸磷酸化位点为主；牦牛FABP4和FABP5蛋白均与PPARG、GOT2间存在互作关系，且其相互间存在互作关系。KEGG富集结果发现，FABP4和FABP5共同富集在PPAR信号通路上。FABP4和FABP5基因在牦牛各组织中均有不同程度的表达，其中在脂肪中的相对表达量最高。【结论】克隆了牦牛FABP4和FABP5基因，明确了其分子特征。牦牛FABP4和FABP5基因在脂肪组织中高表达，与脂肪的沉积和代谢密切相关。

关键词

牦牛 / FABP4基因 / FABP5基因 / 肉品质 / 脂肪沉积