StGBF3生物信息学分析及其对马铃薯晚疫病抗性的调控

摘要

【目的】马铃薯晚疫病是一种毁灭性病害,严重威胁马铃薯产业的健康发展。挖掘马铃薯抗病基因并解析其抗病机制,为马铃薯抗晚疫病育种提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法鉴定和分析StGBF3转录因子的基本理化性质、蛋白结构、顺式作用元件和结构域,预测其跨膜结构及信号肽,并借助农杆菌介导法使StGBF3在马铃薯品种‘大西洋’叶片瞬时过表达,分析StGBF3转录因子在调控马铃薯抵抗晚疫病菌侵染过程中的功能及其作用机理。【结果】StGBF3共编码413个氨基酸,其中丝氨酸占比最高,为11.1%;半胱氨酸占比最低,仅为0.2%。StGBF3蛋白理论等电点为9.07,属于碱性蛋白;脂肪系数为58.62,平均亲水性为-0.794,为亲水性蛋白;分子质量44 511.45 ku。StGBF3与SlGBF3的序列相似性高达92.5%,StGBF3无跨膜结构和信号肽,在启动子区域存在多种响应逆境和防御相关的顺式作用元件。二级和三级结构分析结果表明,StGBF3蛋白α-螺旋有123个氨基酸,β-转角有16个氨基酸,无规则卷曲有259个氨基酸,延伸链有15个氨基酸,占比分别为29.78%,3.87%,62.71%和3.63%。与对照组(25℃)相比,4℃低温处理后‘大西洋’叶片中StGBF3的表达量在72 h达到最大值,是对照组的3.45倍;与喷施纯净水(RO)相比,喷施0.5 mmol/L水杨酸处理马铃薯品种‘大西洋’叶片中StGBF3分别在48和72 h分别显著提高2.57倍和2.87倍;而喷施1 mmol/L水杨酸与RO处理无显著差异。与对照组(CK)相比,晚疫病菌侵染后瞬时超表达StGBF3(OE)的‘大西洋’叶片中StGBF3的表达量在48 h达到最大值。相同处理时间下,CK组叶片发病面积大于OE,且台盼蓝染色结果显示CK死亡细胞数量大于OE。此外,随着处理时间的延长,OE叶片中病原菌相关分子模式激发的免疫(PTI)标记基因(ACER31、WRKY7、WRKY8)的表达量均呈先上升后下降趋势,且在处理48 h时达最大值;水杨酸SA(PR2、ChtA)、茉莉酸JA(PAL2)和乙烯ET(ERF3)信号通路的标记基因表达量在OE叶片中呈不同程度上调,且SA标记基因(PR2、ChtA)的表达量在处理48 h达到最大值,JA(PAL2)在处理72 h达到最大值,ET(ERF3)表达量呈先上升后下降趋势,但差异不显著。【结论】StGBF3通过激活SA和JA信号通路调控马铃薯对晚疫病的抗性。

关键词

马铃薯晚疫病 / GBF3转录因子 / 激素信号 / 基因表达 / 抗病机制