基于ILP标记的50份云南山茶品种遗传多样性分析

摘要

【目的】分析50份云南山茶品种种质的遗传多样性，为山茶种质资源的创新利用和育种进程提供科学依据。【方法】利用筛选出的25对多态性引物，对50份云南山茶品种进行分子标记试验，系统分析了其遗传多样性、亲缘关系、群体结构及主成分。【结果】云南山茶品种共检测到112个等位基因，等位基因数为3～7个，平均为4.48个；有效等位基因数平均为2.44个，观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）的平均值分别为0.72和0.55。Shannon信息指数（I）和Nei基因多样性指数（H）的平均值分别为0.99和0.55，表明云南山茶品种具有较高的遗传多样性。引物的多态信息含量（PIC）平均值为0.52，其中14对引物的PIC值大于0.5，表明这些引物能够有效反映遗传多样性。基于NTSYSpc-2.1计算的遗传距离显示，50份云南山茶品种的遗传相似系数为0.61～0.92，其中‘香妃’和‘凤山茶’遗传相似度最高，而‘大玛瑙’和‘桃红袍’遗传相似度最低。通过Structure软件分析，50个云南山茶品种在ΔK=2时可分为两组，其中一组包含46个品种。主成分分析进一步表明，50个品种在遗传关系上高度相似，且基本聚在一起。【结论】选用的25对引物能很好地反映云南山茶品种种质的遗传多样性（PIC>0.5）;50份云南山茶品种种质群体间高度相似，遗传关系极为紧密。

关键词

云南山茶品种 / ILP分子标记 / 群体结构 / 遗传多样性