花鲈igf3基因SNP位点的鉴定及其与生长性状的关联分析

陶欣; 邱丽华; 张博; 王鹏飞; 闫路路; 赵超; 林云想; 林锋

doi:10.13417/j.gab.043.000109

基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (01) : 109 -116. DOI: 10.13417/j.gab.043.000109

花鲈igf3基因SNP位点的鉴定及其与生长性状的关联分析

陶欣, 邱丽华, 张博, 王鹏飞, 闫路路, 赵超, 林云想, 林锋

作者信息 +

Author information +

文章历史 +

PDF

摘要

花鲈(Lateolabrax maculatus)是我国最重要的海水经济鱼类之一，近年来其年产量已突破19万吨，是构成我国“菜篮子”工程的重要组成部分。但是，由于缺乏有效的遗传标记导致花鲈良种选育技术不成熟，这成为限制我国花鲈产业健康发展的主要瓶颈之一。为筛选花鲈胰岛素样生长因子3 (insulin-like growth factor 3,igf3)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点以及了解其与生长性状的关联性，本研究对同批次9月龄花鲈群体开展igf3基因SNP位点筛选及其与生长性状的关联性分析。实验结果显示，花鲈igf3基因上存在4个SNP位点，分别位于起始密码子下游C+2 990T、 G+3 037A、 C+3 303G、 G+3 602A处，其中前3个位点位于内含子区，第4个位点位于外显子区。尽管单个SNP位点与花鲈生长性状之间并无显著关联性(P>0.05),但双倍型与花鲈生长性状之间却表现出明显的关联性(P<0.05)。其中，双倍型D2(CCGAGGC)花鲈个体各生长性状表现最优，其体重、头长、体高和体宽均显著高于D3型(CTGGCGCC)个体的(P<0.05)。本研究为筛选具备生长优势的花鲈提供了候选基因，有利于花鲈育种工作的开展。