通过目标区域测序寻找新的自身免疫性甲状腺疾病候选基因及相关位点

摘要

自身免疫性甲状腺疾病(autoimmune thyroid disease, AITD)是一种主要由T细胞介导的器官特异性自身免疫性疾病，包括格雷夫斯病(Graves disease, GD)和桥本甲状腺炎(Hashimoto thyroiditis, HT),其发病率与遗传因素紧密相关。本研究旨在确定与AITD相关的易感基因及位点。本研究通过对100例AITD(51例HT和49例GD)患者和50例健康体检者的基因组进行目标区域测序，并对基因多态性与AITD之间的相关性进行了统计学分析，进一步进行连锁分析找到易感基因及相关位点。本研究发现了BACH2基因的5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点(rs12205059、 rs62408219、 rs7742121、 rs7756574、 rs12204886)完全连锁，ARID5B基因10个SNP位点(rs12778514、 rs3740354、 rs3740353、 rs9633555、 rs9633557、 rs9633534、 rs3740352、 rs2393730、 rs2393729、 rs2393728)连锁程度较高，NFKB1基因7个SNP位点(rs230528、 rs230526、 rs230521、 rs230517、 rs230512、 rs4648011、 rs230505)连锁程度较高，它们显示与GD显著相关；BACH2基因24个SNP位点(rs77175037、 rs16882370、 rs77758469、 rs78777913、 rs117721419、 rs78336372、 rs76671310、 rs76587383、 rs75249386、 rs79815784、 rs57765055、 rs75199762、 rs75340880、 rs9444735、 rs61246723、 rs9451336、 rs78318422、 rs117023048、 rs74639869、 rs75487886、 rs80029445、 rs78252829、 rs60148132、 rs58745003)完全连锁，以及4个SNP位点(rs60519986、 rs56835438、 rs58205153、 rs9451298)连锁程度较高，显示与HT显著相关；BACH2基因4个SNP位点(rs12205059、 rs7742121、 rs7756574、 rs12204886)连锁程度较高，ARID5B基因5个SNP位点(rs9633555、 rs9633556、 rs2393730、 rs2393729、 rs2393728)连锁程度较高，它们与GD和HT易感性均显著相关。本研究揭示了BACH2、ARID5B和NFKB1基因的多态性与AITD易感性有关，它们可能参与了AITD的发病机制。

关键词

自身免疫性甲状腺疾病 / 格雷夫斯病 / 桥本甲状腺炎 / 连锁分析 / 单核苷酸多态性(SNP)