水产经济鱼类基因组大数据平台的构建与应用

徐淑坦; 舒道德; 曾魁; 陈明

doi:10.13417/j.gab.043.000261

基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (02) : 261 -273. DOI: 10.13417/j.gab.043.000261

水产经济鱼类基因组大数据平台的构建与应用

徐淑坦, 舒道德, 曾魁, 陈明

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摘要

水产经济鱼类是人类重要的蛋白质来源，对其基因组的研究在分子育种、分析水生生物进化等方面起到重要作用。目前，国内缺少分析水产经济鱼类基因测序数据的综合性数据平台。本文搜集并整理了20余种水产经济鱼类的基因组测序数据，并开发了水产经济鱼类基因组大数据平台。该平台包括数据存储、数据下载、数据分析，以及数据可视化展示等模块。通过该平台，用户可以快速检索鱼类基因的功能、表达水平、基因保守性以及共线性等。本研究开发的鱼类大数据平台将促进水产领域对鱼类基因组的分析。该大数据平台可通过IP 47.96.156.188访问。