青海欧拉羊(Ovis aries)群体中角发育控制基因RXFP2的选择信号分析

摘要

欧拉羊（Oula sheep）属于藏羊（Tibetan sheep）的一个分支。不同于其他国内外绵羊（Ovis aries）品种，欧拉羊的公母羊皆生有大犄角。这是长期放牧条件下自然选择的结果，但其大犄角不利于现代高效畜牧业生产需求。已有较多研究把绵羊无角性状的主效控制基因定位于绵羊10号染色体上的RXFP2基因，但RXFP2基因在不同绵羊品种中的调控作用仍有差别。为加快青藏高原地区无角绵羊品种培育，本研究对青海有角型、无角型欧拉羊成年母羊各15只进行了10×深度的基因组重测序，采用F_ST选择性消除定位角表型主要选择基因，并对欧拉羊RXFP2基因CDS区域及上下50 kbp区域以2 000 bp窗口、 1 000 bp步长进行扫描，对获得的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）进行Tajima′s D、π、F_ST选择分析。结果发现，欧拉羊RXFP2基因及3′下游区域存在强选择信号。通过对RXFP2基因编码区SNP筛选，挖掘了欧拉羊中4个高质量SNPs,分别是位于RXFP2基因第9、第14外显子的同义突变（g.29458690A>G, g.29446067T>C）和第17外显子的2个非同义突变（g.29439053C>T, g.29439011C>T）;突变区域均处于无角、有角欧拉羊RXFP2基因的强选择区域。本研究结果可为无角欧拉羊品种（品系）培育相关分子辅助选择工作提供技术和理论依据，有助于加快无角欧拉羊品种培育的早期选种工作。

关键词

欧拉羊(Ovis aries) / 无角欧拉羊 / 全基因组选择 / 分子辅助育种 / RXFP2