甘南牦牛(Bos grunniens)FBXO32基因突变及其与胴体和肉质性状关联分析

摘要

为了分析甘南牦牛(Bos grunniens)肌肉萎缩盒蛋白32(F-box protein 32,FBXO32)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点，以及基因型与胴体和肉质性状间的相关性，本研究以593头甘南牦牛为研究对象，采用混池测序和竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele specific PCR, KASP)技术，检测了甘南牦牛FBXO32基因突变位点及基因型，分析了基因型与甘南牦牛胴体及肉质性状的相关性。结果表明，从甘南牦牛FBXO32基因检测到7个SNP位点，分别是位于5′UTR区的SNP1(g.267A>C)、外显子1区的SNP2(g.326G>T)、外显子8区的SNP3(g.31231G>C),以及3′UTR区的SNP4(g.31352G>A)、 SNP5(g.31424C>T)、 SNP6(g.31503A>C)和SNP7(g.31504A>G)。其中，SNP1、 SNP4、 SNP5、 SNP6与肌肉嫩度显著相关(P<0.05), SNP3、 SNP6、 SNP7与失水率显著相关(P<0.05), SNP1、 SNP2、 SNP3、 SNP4、 SNP5、 SNP7与眼肌面积显著相关(P<0.05), SNP2、 SNP5、 SNP6与胴体重显著相关(P<0.05)。7个SNP位点构建的9种有效单倍型组合中，单倍型组合H2H2的个体肌肉嫩度小、熟肉率高，单倍型组合H1H2的个体熟肉率高、眼肌面积大、失水率低。FBXO32基因突变位点可作为甘南牦牛胴体及肉质性状潜在分子遗传标记，研究结果丰富了甘南牦牛经济性状分子遗传理论基础。

关键词

甘南牦牛(Bos grunniens) / FBXO32基因 / 胴体性状 / 肉质性状 / 单倍型