马铃薯GRF基因家族的鉴定和表达模式分析

石蒙蒙; 王德颖; 谢浩杰; 秦志广; 刘紫婕; 韩宝佳; 呼雨君; 郭文慧; 孙永旺

doi:10.13417/j.gab.043.000569

基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (04) : 569 -578. DOI: 10.13417/j.gab.043.000569

马铃薯GRF基因家族的鉴定和表达模式分析

石蒙蒙, 王德颖, 谢浩杰, 秦志广, 刘紫婕, 韩宝佳, 呼雨君, 郭文慧, 孙永旺

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摘要

生长调节因子(growth-regulating factor, GRF)家族基因编码植物特有的转录因子，在植物生长发育和胁迫响应等许多生物学过程中发挥重要调节作用。本研究利用生物信息学方法全面鉴定了马铃薯(Solanum tuberosum)GRF基因家族，并分析了其表达模式。在马铃薯基因组中共发现了12个GRF家族基因(StGRF1～StGRF12),其编码的蛋白均含有QLQ结构域和WRC结构域；StGRF基因分布在马铃薯的9条染色体上，染色体片段复制可能导致了该家族基因在马铃薯基因组中的扩张；系统进化分析显示，StGRF可以分为5组，同组的基因成员具有相似的基因结构，且其编码的蛋白具有相似的保守结构域分布；StGRF成员启动子区域存在丰富的激素和胁迫响应相关元件；表达模式分析显示，StGRF在马铃薯不同发育时期及各个组织中呈现出多样化的表达特征，这说明不同成员可能在马铃薯生长发育过程中发挥特异的调控作用。以上结果可为进一步探索StGRF的功能提供一定基础。