水稻OsDOF23的结构和功能分析及其结合蛋白的质谱分析

摘要

水稻(Oryza sativa L.)OsDOF23是植物特异性转录因子DOF(DNA binding with one finger)蛋白家族的一员，但其具体的生物学功能和调节机制不明。本研究以OsDOF23为研究对象，预测了OsDOF23蛋白的理化性质和结构特性，分析了OsDOF23基因的组织表达图谱，及其在水稻群体中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)和插入缺失标记(insertion-deletion, InDel)。此外，成功克隆并在大肠杆菌(Escherichia coli)中表达纯化了OsDOF23蛋白的C末端，并以其为抗原制作了OsDOF23的多克隆抗体，用于后续的免疫沉淀实验。经免疫沉淀和液相色谱串联质谱技术检测分析，从水稻总蛋白中得到与OsDOF23共沉淀的蛋白质组信息。经筛选得到37个可能与DOF23互作的蛋白，对这些蛋白进行功能富集分析发现，从生物过程来说，其主要富集于蛋白质代谢和运输功能方面；从分子功能来说，其主要富集于核酸结合活性和转运活性方面。这些结果表明OsDOF23蛋白可能通过与蛋白质代谢、核酸结合和转运等相关功能蛋白互作发挥其生物学功能。

关键词

水稻 / DOF蛋白 / 原核表达 / 液相色谱串联质谱