二穗短柄草(Brachypodium distachyon)BdCO基因调控开花的转录组学分析

杨龙姣, 路雪萍, 童伟杨, 马培杰, 罗文举, 陈才俊, 王小利

基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (04) : 602 -615.

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基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (04) : 602 -615. DOI: 10.13417/j.gab.043.000602

二穗短柄草(Brachypodium distachyon)BdCO基因调控开花的转录组学分析

    杨龙姣, 路雪萍, 童伟杨, 马培杰, 罗文举, 陈才俊, 王小利
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摘要

CONSTANS(CO)是植物光周期诱导开花途径中的关键基因之一。为探究BdCO在光周期途径中的分子调控机制,本研究对野生型二穗短柄草(Brachypodium distachyon)Bd21植株、过表达BdCO基因型二穗短柄草(CO_OX)植株和BdCO基因敲除型二穗短柄草(CO_A3)植株进行转录组测序分析,对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析,最后观察三种植株的开花表型。结果表明,对比Bd21 vs CO_OX和Bd21 vs CO_A3的基因表达量,分别检测到1 382个和773个差异表达基因;GO功能富集分析发现,Bd21 vs CO_OX的差异表达基因主要富集在小核仁核糖核蛋白复合物、 snoRNA结合和rRNA处理中,Bd21 vs CO_A3的差异表达基因主要富集在类囊体、色素结合和光合作用中;KEGG通路富集分析发现,Bd21 vs CO_OX的差异表达基因主要富集在植物激素信号转导、真核生物中的核糖体生物发生、光合作用-天线蛋白和昼夜节律-植物等通路,Bd21 vs CO_A3的差异表达基因主要富集在MAPK信号通路-植物、真核生物中的核糖体生物发生和光合作用-天线蛋白等通路;在长日照条件下,CO_OX植株的开花时间比野生型Bd21的提前约1.90 d, CO_A3植株的开花时间比野生型Bd21的延迟约7.92 d。综上,BdCO影响光周期途径相关基因的表达,同时影响二穗短柄草的开花时间,说明BdCO在二穗短柄草的光周期途径调控开花的过程中发挥重要作用。

关键词

二穗短柄草 / BdCO基因 / 转录组学 / 光周期

Key words

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二穗短柄草(Brachypodium distachyon)BdCO基因调控开花的转录组学分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2024, 43(04): 602-615 DOI:10.13417/j.gab.043.000602

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