生长激素对感染J亚群禽白血病病毒的鸡胚成纤维细胞系的影响

林玲, 莫国东, 吴强, 张细权

基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (04) : 663 -674.

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基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (04) : 663 -674. DOI: 10.13417/j.gab.043.000663

生长激素对感染J亚群禽白血病病毒的鸡胚成纤维细胞系的影响

    林玲, 莫国东, 吴强, 张细权
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摘要

生长激素(growth hormone, GH)不仅能调节动物的代谢、生长、发育和生殖,也能调节动物的免疫系统。本研究旨在通过转录组测序及生物信息学技术分析GH影响J亚群禽白血病病毒(subgroup J avian leukosis viruses, ALV-J)感染的鸡胚成纤维细胞系(chicken fibroblast cells, DF-1)中的关键基因和信号通路。将空载和GH的过表达质粒分别转染至DF-1,接着均接种ALV-J毒株SCAU-HN06,采用转录组测序技术检测相关的基因表达谱变化。结果显示,与对照组相比,实验组中有上调差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)122个(49%),下调DEGs 127个(51%)。通过GO功能富集分析发现,DEGs主要富集于新陈代谢过程、生物调节、细胞过程、细胞部分、催化活性和结合等过程。经KEGG富集分析发现DEGs主要在免疫系统、信号转导、信号分子和相互作用、细胞生长和死亡等通路上富集。进一步构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,筛选出7个免疫相关基因进行实时定量PCR(RT-qPCR)验证,其中TRAF1、DSTYK、HESX1基因的表达趋势与转录组测序技术(RNA sequencing, RNA-seq)的测序结果相一致。本研究通过生物信息学分析挖掘出可能参与调控ALV-J的关键基因和信号通路,以期为禽白血病病毒-宿主相互作用的关系提供新的见解,为禽白血病的净化提供新的思路。

关键词

差异表达基因(DEGs) / 生长激素(GH) / J亚群禽白血病病毒(ALV-J) / 转录组测序

Key words

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生长激素对感染J亚群禽白血病病毒的鸡胚成纤维细胞系的影响[J]. 基因组学与应用生物学, 2024, 43(04): 663-674 DOI:10.13417/j.gab.043.000663

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