缘漏斗蛛(Agelena limbata)毒腺转录组学研究

杨梦慧, 张海珠, 刘衡, 杨志斌, 赵昱, 杨自忠

基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (05) : 817 -827.

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基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (05) : 817 -827. DOI: 10.13417/j.gab.043.000817

缘漏斗蛛(Agelena limbata)毒腺转录组学研究

    杨梦慧, 张海珠, 刘衡, 杨志斌, 赵昱, 杨自忠
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摘要

为了探究蜘蛛毒素多样性,获取毒素基因序列,进一步研究蜘蛛毒液的成分与应用,本研究在对缘漏斗蛛(Agelena limbata)毒腺进行解剖后采用高通量测序技术对缘漏斗蛛毒腺进行转录组测序,并结合生物信息学方法对转录组进行分析。测序共获得43 157个单基因(unigene),经NR(non-redundant protein sequence)数据库注释比对,与食母穹蛛(Stegodyphus dumicola)同源性最好。GO(the gene ontology resource)富集中蛋白复合物和免疫系统进程所占比例最多。KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)数据库中与代谢相关的通路占比最高。Uniport数据库中比对的结果显示,毒腺中蛋白质的主要作用为抗菌、杀虫、阻断神经通路、阻断钠离子通道等。简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)位点中T/A、 AT/TA与TG/CA出现的频率最高。通过单基因的功能注释,初步了解蜘蛛在捕食时毒腺的基因表达情况、基因主要行使的功能及参与的代谢途径,为了解蜘蛛捕食过程提供了基础。此外,根据序列同源性推断结果,发现缘漏斗蛛毒腺毒素中富含半胱氨酸毒素多肽及酶类,还有一些在生物医药领域也发挥重要作用的酶类,例如金属蛋白酶等。综上所述,缘漏斗蛛毒腺中含有丰富的毒素基因,本研究为后续的研究提供了转录组数据来源。

关键词

缘漏斗蛛(Agelena limbata) / 毒腺 / 高通量测序 / 转录组学

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缘漏斗蛛(Agelena limbata)毒腺转录组学研究[J]. 基因组学与应用生物学, 2024, 43(05): 817-827 DOI:10.13417/j.gab.043.000817

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