土库曼蝗线粒体基因组特征及其系统发育分析

摘要

土库曼蝗(Ramburiella turcomana)是新疆草原常见的危害蝗虫。本研究基于二代测序技术获得土库曼蝗线粒体全基因组序列，并对其进行注释及特征分析。采用近邻相接法(neighbor joining method, NJ)和贝叶斯法(bayesian inference method, BI)构建网翅蝗科(Arcypteridae)系统发育树。结果表明，土库曼蝗线粒体基因为双链环状DNA,全长15 670 bp,具有明显AT偏好(72.21%),共编码37个基因，包括13个蛋白编码基因、 22个tRNA编码基因、 2个rRNA编码基因，以及1个非编码控制区域(D-loop区)。土库曼蝗线粒体基因组发生了蝗亚目(Locustodea)普遍存在的DK重排(DK rearrangement)现象。基于网翅蝗科已报道物种线粒体全基因组构建的NJ树和BI树具有相同的拓扑结构，其中土库曼蝗与16种网翅蝗亚科(Arcypterinae)蝗虫聚为一支，并位于网翅蝗亚科最基部，其余6种竹蝗亚科(Ceracrinae)蝗虫聚为一支，暗示土库曼蝗是网翅蝗亚科中较古老的物种。本研究公布的土库曼蝗线粒体全基因组为土库曼蝗属(Ramburiella)中首次报道，为挖掘土库曼蝗属其他物种线粒体全基因组提供了分子生物学参考。

关键词

网翅蝗科 / 土库曼蝗 / 线粒体基因组 / 系统发育分析