基于SSR分子标记探索贵州省黔西南州杜仲遗传多样性

张玲; 董旋; 孙志鹏; 曹瑞; 赵德刚; 赵懿琛

doi:10.13417/j.gab.043.001735

基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (Z2) : 1735 -1745. DOI: 10.13417/j.gab.043.001735

基于SSR分子标记探索贵州省黔西南州杜仲遗传多样性

张玲, 董旋, 孙志鹏, 曹瑞, 赵德刚, 赵懿琛

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摘要

杜仲(Eucommia ulmoides)是一种源自中国且具有2 000多年历史的药用树种。贵州省黔西南州杜仲种质资源的收集和利用受到资料缺乏制约。为解决这一问题，本研究初步评估黔西南州和贵阳市的杜仲种质资源的表型多样性，并使用10对基因组多态性简单重复序列(simple sequence repeated, SSR)和5对转录组多态性SSR评估种质资源的遗传多样性。结果显示，62份种质资源具有较高的叶色多样性和遗传多样性。进一步进行分子方差分析(analysis of molecular variance, AMOVA)发现，75%的变异存在于个体之间。在种群结构分析中可将不同类群划分为3个不同聚类，与主成分分析(principal component analysis, PCA)结果基本吻合。利用非加权组平均法(unweighted pairgroup method with arithmetic mean, UPGMA)和算术平均树形图构建杜仲系统进化树，可将供试材料划分为4个类群，与地理来源高度一致。综上，本研究成功利用SSR标记分析黔西南州杜仲种质资源的遗传多样性，为该地区种质资源的合理保护和收集提供一定的参考价值。