渭河高原鳅线粒体基因组特征及其系统发育分析

摘要

渭河高原鳅（Triplophysa weiheensis）是分布于黄河上游的特色鱼类，本研究旨在研究渭河高原鳅线粒体基因组的结构特征，并阐述该物种在黄河水系高原鳅中的系统发育地位。本研究采用高通量测序技术获得渭河高原鳅线粒体基因组全序列，并基于线粒体基因组全序列构建高原鳅属系统发育树。结果表明，渭河线粒体基因组序列全长为16 570 bp,包含13个蛋白质编码基因、 22个tRNA基因、 2个rRNA基因及2个非编码区（D-loop和O_L）,其中D-loop区A+T含量最高（65.87%）。蛋白质编码基因中，12个基因均以典型的ATG为起始密码子，仅cox1基因以特殊的GTG为起始密码子。21个tRNA基因呈典型的三叶草结构，仅tRNA^Ser（GCU）因缺失DHU臂无法折叠形成典型的三叶草结构。利用最大似然法（maximum likelihood method, ML）基于线粒体基因组全序列构建的系统发育树显示，渭河高原鳅与斯氏高原鳅（Triplophysa stoliczkai）及赛丽高原鳅（Triplophysa sellaefer）聚为同一小分支，三者的亲缘关系较近。本研究补充了渭河高原鳅线粒体基因组的基础数据，有助于加深对高原鳅属的系统进化关系的理解；理清了高原鳅不同物种间的进化关系，为后续开展高原鱼类适应进化、选择压力等研究夯实了基础。

关键词

渭河高原鳅 / 线粒体基因组 / 结构特征 / 系统发育